Sol Genomics Network

Solanum lycopersicum gene Solyc08g077420.2

Name Solyc08g077420.2	Type Gene	Organism Solanum lycopersicum
Synonyms / aliases Solyc08g077420	Length 13,091

Description

ATP dependent helicase (AHRD V1 **-* A8NEE6_COPC7); contains Interpro domain(s) IPR018999 RNA helicase UPF1, UPF2-interacting domain

Location(s)

SL2.50ch08:61276784..61289874

GFF source

ITAG_eugene

From BOGAS: 1

Length: 13091

Genome Viewer

Related features

Features that are parts of this gene

Type	Name	Location	Length	Strand	Phase
mRNA	Solyc08g077420.2.1	SL2.50ch08:61276784..61289874	4,473	+	n/a

Add items to a list:

Genomic sequence

unprocessed genomic sequence region underlying this gene

>Solyc08g077420.2 SL2.50ch08:61276784..61289874
CGATCTCCCTCAACCTCCATACACTGTTAATTCCTTAACTGTCTCCAACAAATCTCAAACAAAAACACAATTTGTTTTCTTCTTCTTACGCGCATTCAAATTCCTAAACCCTAACCCTAACGCTGACGCTGAATTCGTATGTGATTAACGAGTGCTGTCTGTCATCACCAAAAAAATGGATTCTCAGGGGAATAGTTTGTACGACACAGCGTCGCAGCCGGACACGGGTAACGATGTGTACACATTTTTGGAATTCAACACACAGGGAGAAGAATTCGATTATCCTGAGTTTCATGAGCTTTCACAGCCAATTAGATCATCTGCTTGGCCTACACCGTCTGATTCCTTAGTCTCTGAAGTTCCTGATCGTCCGCAGTCGTCGTCTGATGCTTCTCAAGCGTCAGGTAAATCACGTGGCGGTGACGGTGGACGGAGTAGGAGTAGTAGTAGCAGTAAGATTAGTAGTAATAAGGCGGCAGCGGTGGCGGTGGATGCATTGGCGGCAGGGATGAGCGGGTTGAATTTTGAAGAGACTGGTGATGATGAGAATTTTGAGTATGGAAAAGGAGATTTTGCGGTTGAACATGCTTGTAAGTACTGTGGAGTGACGAATCCTGCTTGTGTGGTTAGGTGTAACGTCCCATCCTGCCGCAAATGGTTCTGTAATTCGAGAGGGAATACTTCGGGTTCTCATATTGTTAATCACTTGGTATGTATGCTATAGTTTTCTATGTTGTGTTAAATACTTATGATTATGGAAATGTGTTGAAAGAGGGACCAAATGTTTTGTTATACAAATGACAAGCTACTTTCTGTATGCTGTGTGATGTTTAATTTAGTGTGAATTGTGAAATGACAGTTACTTTACTTTTCAAAGAAGAATTGCGAGTAATAGTAGTGTGGACCTTTGAACAGAATAGTGTGTTTTTGAAATAGAAGCTTTAAACTTGTGAATAATTAGCTGCTTTCGAGCACATTATGTAATATTGTCTGTAATGAGGTGTTGTAACTTATCAAAAAAATTTTGTGAGGTGTTTTGACCTACGGTCATTGCATGAAAAATTCTTTTCAGACCTGCTGTTTTGTTTTTTCCTTGTATGATGCAATTGAAGGCTTTTGCTGCCTCTGGTTGAAAAAAGGAGAGAGAAGAAAAATTGAACTGAGCTCCCATGAAGAATCTTAGCATCCTGGTTGTTGGCTACTTGAACTTTCACATTATTGGTGCGGGTTTGATTTCCCCACCTTATAATCCCCTCCCCATTTCCCCTTCAGAAGAAAAGAAAGAAAGACTGAGCTCCCATAGTGTGGCTGTCAGGGATGATGACAATTACTATAGCTGGTGGGATTGTAGAAAGCTGTTGCATTGGACTGAACAGGAAGACTTCACCAGTAATTTTTTAATAAATCAATTTATTGGCGATTTTAGGAACTGGAGAACAACTTATTGAAAGGTGGAATAAATCAGGCCCAACTGGAAAAGAATGTAGTGGATTTATATCTTAGCACTAAGTTGTTCCTCATTTTAATCTATAACTGAGGAGTCGTTCGTAGAGTGTATAAGAATAATGCTAAATAGAGTGTATTACTAATGCTTGCATTAGCAATGCATGGATTAGTTATGTTTGCTTTAATTATACATAGACTATTTTTATGCATTAAAATAGCATGCATTGCATTAAAAAATCTATTAACAAAGATACCATCCACTATTATGGTGGAAAAGATGTTAAAAAAGTTGAGGGGCAATTGGGTCTTTAATCAGCTAATGCATGCACTAAAATCATTGCATTGCTAATAGCTAAAAATTCATGGTATTAGTAATACTCAGTTGAGTGTATAACCAATGCAAACATTAGTTATACATAGGTTAGAAAAGAGTACCAAACAAGGTGAATATACTACACAAGGCTAATGCATGCATGATTTTTCCTAATACACTCTACCAAATGACCCCTTTTTTTGTTTAAAAAAGAATGTGGGATTTGTACATCCAACTCCAACTAGTTTGATTAAAATGATCTAGTGTTAGTTGTTTAATTTATGAACTGAGCTTATTTGTCACTGATGAAGAATCCTTTGTGCCTCTTAATATGTTCTCTTTCCCTTTCGAATACTCTGATGTTATGTATGAGGTCATTTCCCTTGTTCTGTTCTTTCTCTTGGACATGGCGTCATGGTGACGGATACCCAACATGGTAATATGAAGGCGTTGTTCTTTAGACCCGTTTTCTTGTGTTTGGAATGCTAATATCAGGGCCTATAATTTTGTGGTGTCCATTTCTTCTTGTTCTGATAACTAGGTTCTTGTCAGTTAGTTGAAGATTTTATTTCTTTTGCAAGTCTACTTTCTTAGATGTAGAGGGAAAATTAAACTGATATCTGTATATTATCAAAGCTGAGAAGCGACGGCATTATCTACTTAAAAATAAGTAAAGAGCGAAGGCAGAACCTTTTGCTGATTTATTAAGGGAGTTGATGCACTCTATTTGATCTCTCTTTTTTACATGCTCAATGTCCATTAGATGTGAGTTCACCTATAAATATGACTCATATTCATGTAAGAGTGTGCTAACATTTGAATCTTGTTACTATAGTAATGAGTGGGATATATTCACGCATCGACAAAAATAGGTTATGAGCTATATCTGTTTGCTAGCTGTATCTTGGTTTTTCCTGTAGTTGGTACATCTGTCATTCTCACTTTAGAAACAAGGCATTTGGAAATTTCTAAATTTAATCTACAACATTGACCTTAGGTCCGAGCGAAACACAAGGAGGTTTGTCTTCATAAAGATAGTCCATTGGGAGAAACAATTCTAGAGTGCTACAACTGTGGATGTCGAAACGTCTTTCTTCTTGGCTTCATCTCTGCCAAGACCGAGAGTGTCGTTGTTCTCCTCTGCAGGGAACCATGTTTGAATGTTAATGCGCTGAAGGATATGAATTGGGATTTGAGTCAGTGGTGCCCCCTAATCGATGATAGGTGTTTCTTGCAATGGCTGGTTAAGGTTTGGGATACTCTTTCTTGATTCCTCGTATGGTGCTTTCTGAGTTTTGCTCCTCTCCTATTTCTGTAATCTATTGCCTGCTGCAGGTTCCATCAGAGCAAGAACAGTTGCGGGCACGGCAAATCAGTGCTCAACAAATAAATAAAATTGAAGAATTGTGGAAGACAAATCCTGATGCTAATTTGGAAGATCTTGAGAAGCCAGGTGTGGATGATGAACCTCAGCCTGTTGGCTTGAAGTATGAAGATGCCTATCAGGTGTCTTTAATGTTGCTATCCTATTTTGTTTAACTTTTGTTGTCTAATAGATGCTCCATAAAATCACCCTGGATTTTCATGAATTGCTCCTGTGGTTGACATGTTAATTAAGTTTGGCTTTATCCTTCTAATGTAGTATCAAAACATATTTGCACCGCTGATCAAGCTTGAAGCTGACTATGATAAGGTATGTCAGCCATTAGATGTTTTTTTTTACTTGCTGAATTTTGAGTGCATTATGTTTCTATTTTATTTCTTGGCATTTTGTTCCATACAAAAATGTCGTTTGCTTTCCTTTAGTAGATAATTTTCCTTTGTAGGTTTTTCTTTTGGATAGTGTAGTAGTTCCTTTTCTTTTGGGTGATTAGTACCATTAGAATTGCATTTTAGTAGAGTGAGGGTCTCTCCAATAGTCTTAAGTCAGAAGTAACCTTATATTTGCTCTTAAATGTGTCTTATCTGTAAATTATGAGATATTTCTTCTTTCTTTTATGATTGAGTTCTGTAGTCTATCTAAGACATTGTTTCCTCTTATGTGTTCTATCCCTGTCAATTACCTAATGATATCATCCTTTTTTTCGCGAAACTGATAATGTTGTATAAGACCCCAAAAATTTCTACTGATAGTGTCGTTTCTCCGTCTTGCTATTTTTTTATTGAGGTTTCATACTGCCTGACGTAACAAGATTTTATTTCTATTTGGTAGATGATGAAAGAGTCTCAAAGTAAAGATAACCTCACTGTTCGGTGGGATATTGGTCTCAACAAGAAGCGGGTAGCATATTTTGTTTTCCCGAAGGTATATTATCATCCTCATAAATGTTGCCTCCTATGCCTCTCATCAAGCTTGGAATTCTTGTGTTGTTACATTGTTGTCACTGCCAATTCTTTCTTGAAGTGGGATGTCTTGTGTCTTCACTCATCTGGACTGAACATAGGGTTCTGTTCTTTTAGGAAGACAATGAGTTACGACTTGTACCTGGTGATGAGCTACGACTGCGTTATTCAGGGGATGCAGCTCATCCAGCATGGCAGTCAGTGGGGCATGTGGTATGGACCTTGATATCTCACCCTGTTTAGAAGGGAAAAACTATGGAGCCTCCTTAAGAACACCCTTAACACACATACAAGATGACTTAGAAGGAGAAGTGTATTCTTCGACATCTGGTATTTGTGTGTTTTGGCTGGCTTTTTGACCAAGACTGGTGAATTGTTTCTTCGATTTTCAGATAAAATTAACTGCTCAAGAAGAGGTTGCCCTTGAGCTTCGTGCCAGTCAGGTACATTAGTTTTAGGACTTCCTATTCTCTTTCTTGTCATCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAACAACAACAGAAAAGTTACATCACGATTTGTGTTCTTAATTCGTTTGCGACATTTCTGTCTTGCAGGGAGTTCCGGTTGATGTGACCCATGGGCTGAGTGTTGACTTTGTTTGGAAGAGTACGAGCTTTGACAGAATGCAAACTGCAATGAAAACTTTTGCTGTGGATGAGACAAGTGTTAGTGGGTGAGTGAGAATGTCTGAATTTTCTAAAAGAAGTTAAAAGAAAATGATACATGTCCTTCTCCCTCTTGTTTGTGTTATTTTGCTTTAAATATGTACTTCTACATCTTGCTTATACACATCTCACATTTACTTTCTGACTTTCTTCCAAGTGTTGATATACTGTGATTCTTGGAAGCATTTATGTAGCAAGAATTCACTATCCTGCTTTACTTTGCTGTTGCTGAATGTGATAGATAATTCACTTTGCTTTGCTGTCCAGTCTTGGTGTCACGAGGGAACTTTAAAGTATATGATATAGCTGTAGTTTTTCATACATGATGACCTTTTGTAAATAACTTTGCTTGTGTTAACCGGATTATAACTTCTTTATTAGGATACTCGTGTTTGATTCATTGATTCTACTATGTAGGTATATTTACCATCATCTGCTAGGTCACGAAGTTGAGATGCAGATGATTCGGAATGCACTTCCTCGCCGTTTTGGTGCTCCTGGTCTTCCAGAGCTTAACGCGTCTCAGGTTGGCGGTTCTGTCTTTCTTTGAAGTTTTATCTAGTTTCAGTATCTATCTTGCTCCTACCCGTTTTTCAGGATTATTCTTAATATATAATCGGGGGCAAGTTCATAGTTGCAAGTGCACACCTTAGGAATAGAAGTTATGGGATTTATACACGTGCACACTTGTGCATCTAGAGAACTAAACATGTTATGATAGTTACGTTAGCTGACTATTCTTACTAATGTCACCACCTGCATCCAATTTGTTGGCAGTATTGTTTGGTTGCTCTGCTCATAAAGTTTTCCCTCCGCTCAGCTGTCAGTTTATTAGCCTGAAAATGGTGCCTTATAGCTGCTTGCTCCAACCCCCAAAAAAGAAAAGGGGAAAAATGGTCACCCCATCACATCTCTGATGGATAGAAATGAATAAGAGGAATAATATTGTCTTATAGTACATGTGCATTTTTCTAGGTTTTTGCTGTAAAAAGTGTTCTCCAGAAGCCCGTCAGTTTAATTCAAGGTCCGCCCGGTACGGGAAAAACTGTTACCTCCGCTGCCATCGTGTATCATATGGCCAAGCAAGGCCAGGGTCAGGTAAGTTAATTGTTCTACAAGTTGACCTTGTCTTCATTGTTTAGTGTAACCCCTTGATTCTAAGCATATTCTCTACTGTTTCTTTGACAATTTTTCATCAGGTTTTGGTCTGTGCACCCAGTAACGTGGCTGTGGACCAATTAGCAGAGAAAATAAGTGCTACTGGACTGAAGGTGAGGAGCAGCATTTGTGTGTATCTCCCTCTGCTGGATAGCTTTCATTGAACTATTCTTACAAGTTGTCATTCACTATTTTTTTATCGTACAGAAGATTCTATGATTATGCATCAAAAATAAAATACTCACTAGTTCCAGAAAAATAACATTCAGTCATTGTTTTTGCTTGGTTATCAACACATGTATCTTTGTTGTTGTATAATGGAAGTAGCCTATTGAAATTTGAACTACTCTTCCTTGTCTTTTTGACATCACATGTTCCTTTTTCCCCTCCTCTACACCCTTTCCATATTTTTTGATTGGTCAGGAGTACTTTTCCATAACCTGAAGGCGCCTTGCTGATTGTTATATAACCACACAACTGAAGGAAAGAGAAATCAAAAGTAATGAGAACTTAGGAGTCACGGAAAATGAATAGAAACTTCATCAAATGTTGGATTCTTCAGTTATTTTTGTTTGAATTATTTTCTCCCAGGTTGTCAGGCTCTGTGCTAAGTCGAGAGAAGCTGTCAGTTCTCCAGTTGAGCATTTAACCCTTCACTATCAGGTTAGTTCTTTTGTGAATTATCACACACTTACGTATAATTTTTCTTTCAGAACCTTCTATTCTTTAGTTTCCATCCATTCTTCAACTCTTTGTCCATGCAGGTTCGTCATCTTGACACATCCGAGAAGAGTGAACTTCACAAGTTACAGCAACTGAAGGATGAACAAGGTTGGTGTTCCCTTATAGTTTGTTTATGCTTTATGGATATTGGTGTTCCAATTGAACTTGTTAGCTTGAAGAGTTTGGTTTTCTATGTACATACACGATCATCTGTTTGCAGCATTGATAAATTTGTGCACATTATCCAAATGCATTTAATTTATTGATGTTCAGGAGAACTCTCCAGCGGTGATGAGAAGAAATATAAAGCTCTGAAACGGGCTACAGAGAGGGAGATAGCTCAAAGTGCTGATGTGATTTGTTGCACCTGTGTTGGTGCTGGAGATCCTAGATTGGCAAATTTTAGATTCCGTCAGGTTGGTTTGCCTCAGAGGTGAAGATGTCGAGGATCTTTAGCTCTTTTTCCTCACTTTCTTATCCATTTAGTTTTTTGTGTGCGCCTTTTCATTCATTTGGATGTTTCCTTGATGGTTTCGGCATCTCTTCTATGCAACCTTATTGTAGGTGCTCATTGATGAGTCCACTCAAGCAGCTGAACCTGAATGCCTTATTCCTTTGGTTCTTGGAGCAAAGCAGGTAACTGCTGCTATTTATTTCATATTGAGGTATGCTATACATATGGAAGATACTTACTGTCATGTATGTGCTAGATTGTCCTTGTTGGTGATCACTGCCAGCTTGGACCTGTCATTATGTGCAAGAAAGCTGCACGGGCTGGGCTTGCTCAATCCCTGTTTGAACGTCTTGTACTGCTGGGTGTGAAGCCAATCAGGCTGCAGGTGAATTTCTGGGCGGTTTTTTTGATGCGTTAACTTTTCTGGGATTATGAGGTTGGATTGAATTATGAGATCCAGCGTTTTCTCTCATTCTTCATGCAATAGATATAATGATTTGAAGCGCTCATGTGTTCTATGTAGACAGTTATTTCTTCTTACCTTTTTTCTGGGTGGTGTTTATATATATATATATATATATATATATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAACTGTAGTGTCGGGGCCAGCTTGCACGCACCTGAACTAATTTCACAAGATACCTGTTACCTCCCACAAGCAACAGCTAGATCTTGGACAAAAGATCTCTAGTTTTAAGTGTGTGATATTCCCATGCTTCATACCAGCTTGTGTAGTGGGACTATCAAGTCCCTATCCTGCTTAAACTTAGATTTCAGTTGTTGAGTTTCTGTGCATGCCATTCTAGCCCTTTTCATTTGCCTAACAAAGTACAGTCGTAGATACTCTCCTTCCATTCCTTTCGTGATTGTCTGTTCCTTTCTGTTAGCATTTATCATTAACTTATTGATTATTGTCTATGCTGTTCAGACTCCTCTTTACTATAAAATGTGTGTACCTTCTCTGCTTTTCCCTTTATATTTGCTCAATGGATATATAATGTTGGTTCTCCTGTCCATTGAAATGCAATATTAGGTACAATACCGTATGCATCCTGCACTGTCAGAGTTCCCGTCAAATAGCTTTTACGAAGGTACACTTCAAAACGGTGTAACCATCAACGAGAGACAATCATTAGGCATTGATTTTCCTTGGCCTGTGCCAAACCGTCCCATGTTCTTTTATGTCCAGGTATGCTCAATTTTATATAAACAATTATGTCTGGGTATTCTTAATTTATATAGTTGATTTCTTATTGTCCTTCCTAGAGTGAAAAGATGTATATATTTTGTTTCTGTTCTCTCTTGATTATCTTTAGATATTACTGCTATGGCTATGAGATACTAAGGTTGTGTTGTAGAGATATAGCCATATAGGCTAATGATTTCTTTTTCACTTTCTATTTTGTGTATTCCCATTTCTGGCTGTATAAAGTCATACGCAGTTGTTACTCTCTATATAGATGGGACAAGAAGAGATCAGTGCTAGTGGAACTTCCTATCTAAATAGAACTGAAGCTGCTAACGTTGAGAAGCTAGTGACTACGTTCCTCAAAAGTGGTGTAGTCCCTAGTCAGGTATGTGGTTATTTAGATTTTTAACTTGTCATTTGGATGCTAAAGAAGTTGGTACAAAATTTCTGCAAAGTAAAACTTAAAGATGGAATAATCATTTTCAAGCATATAAATATATTTAAGAGAAACCACAATCCTTAAAAATTGGCAAGACTTAATTTGAAGAGATTCCTATTTTTAAGTTAAAAAACCTGTACTTACACTTACCTACTTCCAAATGCATAGTGGCAGATAACTTTTTTCCGGTACTAAGAATTCCTTTTCTCAGCAATCAAAGTGTCTAGGAGAGTTGAATAATTCATTTGTATACAACTTTGTCTGTATCTTATTTGCCAGATTGGAGTTATAACACCATATGAGGGTCAACGAGCATATATTGTAAATTATATGTCTAGAAATGGTGCTTTAAGGCAGCAACTTTACAAGGAAATTGAGGTAACCTGTGAATAGAGGGGCTACTTACCGTTCTCTTATATTCTTCCAATTAACTGAGTAATTTCTATCATCAGGTTGCAAGTGTAGATTCATTTCAAGGAAGAGAAAAAGATTATATCATCTTGTCTTGTGTCAGGAGCAATGAACATCAGGTTGGTATAGATATCCAGAATTATCTGTTTTCGCTTGCTGTTCATGTTAATATGATACCAATGTGGTTTAGTGTGTATAGTTTGTCATCTTCATGTGATGTTTGCTTATTTCTTTCCCGCTCTTTCCACAGCCTGTATACACCATAACCTTTGATTTTTTGCATTCCATCTTTTTTAAAGTGTTAAAAGGCTAGTTTTTCACCCCTTTTTGATTTGGGGGTACAAGGGGTAGACTGAGTTTCTAATACTTTGTTGGTTGTTCTGGCCAGAAAGTTAAGTAAAACAAAAAAAACATGCTGTGCGCAACGTCTTATATTGCCAGTGCCTTATAAATAACTGGTGCACTTATAGTTTACTTTGCTATTCATTTCAGGGCATTGGGTTTCTGAATGATCCTCGCAGGCTTAATGTTGCTCTTACACGTGCTCGTTATGGAATCGTTATCCTAGGAAATCCTAAAGTGTTGAGCAAGCAGCCTCTCTGGAATGGGTTGCTGACACACTACAAGGTAATTTCTTAAATAGTTCTGAATGAAAATGCTTAAGGTAACTTTTTCTTTTTTTTCTATTGTAATGCTGATTTTTAAAATGCTTATTACCTAAGATTCTGCATTTCACGATTATTCTAAACTAAGGTGTTCTTGAACTGGAAATTTTTGATATCTTGCTCATTGCGTGTTATTTTTGGGCCAATCCTCTTTTGAAGAGGGTGTTGTATTGCTGAGTTTGTCTGAATACATCATTATTGCTTTAAACTCTTGGATTCACTTCAATATCTCTTTTAGTTTATTACGCCTTGAGATGCTCAAACTTCTACATGTTTGTCAATCAGGAGCATGAATGCTTGGTAGAAGGTCCTTTAAATAACTTAAAGCAAAGTATGGTACAGTTTCAGAAGCCAAAAAAGGTACTTGTTGGTTTTTATATGTTCTTTCTAAGTTTGATGTTTGTGCCTCAGCAGAATGTATCATATTGTGGTTCTGATGTGGTGTTGATCTTTCGTATCATTGGTTTTGCAGATCTACAATGACCGCAGGCTTTTCTTTGGTGGTGGACCTGGAATTGTTCCCAGTGATAATTATGGATCTCCTGCCTCATCAAACCCCAATGCTGACAGGCGAAGTAGTCGCTCTAGGGGTATGTTGGAATTTAGTTTTTCTCCTATTGGGTTACTTAACACTCATAATTCAGTAGCTTTTATCTGTATAGTAGAAAATGTTATGAAATGGATGTGACTTTTTCCATATGGATCCTTCTAGAGGCGCGAAGAATTTGACAGGCAACTCATTAGTCATGCATGTTTACTGTAACCCCCTCCCCCCCCAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAAGAGGCACCATATTGACGCTATTGGGGATAAACCCGTGTACGAGCATATACATAGTAGATTATTCAGATAAGATGTGATTTCCTAAAAAAAAAGAGTACCTACTCGTAATGGGAATCCGTAGGGGCTCCAAAATCTACACATTAACATAATGGTCCTCGTAATTGGGTAGAAAGCAGTTGCTTGGCATTGATGATTCAACGTTGAGCAGGTTTCATCATCTGATAAGGTTGTTAGAATCCAAGCTACCTCCTTTACCTGCCAAGTTCTCTTGAATTAGTGCCGGGAAGTGGAAGCATGTGTTATGTTCCAAATTACAGTGAGTTCATACATCTAGTCCTGTCTTATGCTCAGGTTTTGAATATTTTATCTTTTTAATAGGTTCTTACATGGCACCTCGTCCATCCAATGGTACTCACAGACCTGGTGTCTATCCTTCTGGTTATCCAATGCCTCGAGTTCCCATCTCCCCTTACCATGGCGGCCTTCCCCAACCGTATGCAATTCCTGCTCGTGGTGCTATACAGGGACCTGTTGGAGCTGTACCTCATGTTCCACAGCTAGGTAGCCGGGGTTTTGGTGCCGGGCGTGGGAATGCCAATGCTCCAATTGGTAGCCATCTTTCTCACCAGCAAGCCTCCCAGCAACCTATTGGAAGTCATGGACCTAACTTCAACTTTTCTGCACTTGAAAATCCAAACAGTCAACCATCCGGAGGACCTTTATCTCAGCCTGGATATGCTTCTAATGTTAGTAAACCTGTTAATTCTTTCAATATTCTATCATATTCTTATTGTTCTAGTTGCAAGCATGTTTTTTTAATTTTAAAATTCATAGATGGCCGTTCAAGGACCAAGCCAGACATTTCGCGATGGATTTTCAATGGGCGGCATGTCACAGGTAATTGATTTTGTTAATCATTGTTGTTTGCTTCGCCAAGTATCACATTTATCCTTTAATTTTTTAATCAGGACTTCTTGGGAGATGATTTCAAGAGCCAGGGATCCCATGTTTCATATCATGTTGCTGACTTCTCTACACAGGTACTGTCGTACACATTCTCTATCTAGCAGTTCATATGAAGCTGCTATTATCCCATCCCTGTCCATCTAATTTGTACGTGCATTTTTTTCCCTTTTGTTAAGTAGTATTAGCTCAGCTTTGTTTCACTTCCGTTCAGGCTTCTCAAAGTGGATATGCTGTTGATTATGTAAATCAGGGAGCACAGGCTGGTTTTCCAGGAAATTATTTGAACCGGAATTCACAAGCTGGATACTCACGTTTTGGTTCAGGAAATGAATTTATGTCACAGGTAAGCTGTCCGGCCCCTTGGCCCCTTCATTTCTTGCTCTATTAAGTTTGTGGGGGGGGGGTTTGGAAGAGGTCGCAGTCTCTTCATAGGTGGTGAACAACTGTTATCTAATGTGGTTTTCTTTGCTGATGTTTGTCTTCTTCCTGTTTACGTAGGTCTAATGCTTATGTAATCATTTTGATTGCTCTGCAGGATTACATGACTTATGGATCCCAAGGTCTCTTCACACAAGCTGGATACAGCGATCCATCACAAGAGGACAGTTCACAAAACCATTTTGGCATGTCCAATGCAAATCCACTTCACTCTCAGGTTACTGCATCATAATTCTGCTTGGTAGTTAACAAGATCATTGAAAGACTTCCAAATATGAAATATGCACATCACGTGAAGTCTCTAGCTACTGGGAAGTTCATTCTTCACCAGTATCAAGATTTAGGGGACTTCCCGTGTTGCAAAATGATCTTTTTATTGGTTAGTTCACCAGTCTAATTAATGGCAATATCAATTTTGTTTCTGTTTTTCTTCAGAGTTTACTCAATCCACTGTACTCGCAGCCTTTTGGGCATTACAACACCCAACCATTGAACATGCAAAGTTCCCAACCTCAACAGCCTCAAGCCCCACAAGTCCAAGGCTCACAAAATCAGAAACTCCATTACAACGGTTAAGGACCACCAGTTTGTGGCTTTATGGATTATGGTTTTGCATCCAGCAACTTGGTTTGTGCTGTCATGTTTGACTGTATTTTCTATGTAAGATGGAGTAAGAGTGCTGAAATTCAGGTCAGTTGGTGACAGTATGATGACTCTGAATGATTTGATTTTGAGGGATGAGGTGGAGGAAGGCTCTCTGATAAAGAAAAGCATGGGCAGCACATCCGGTGCTGAGAAAGGTGAAACAAGCTTGAGGTTGTGTGCTGTGCAAGAGAAGGTGACTATTTATTCAGGAGAGAACATTACATGGCATGGAATTAGTCGGAGGGTGCCGGTTGTTATTACAGCCATGCTTGGAAGCTGCTAGCACTATCGTCCTGTACAGGTATTCTGGCAAAAATCAGCATAATCCTTTCAGCTCTTCCTGACATGTAACTAATACTCACTAGTAAGTAGACTATGTGATGGATGTGTTTGTTAATAATGCA

Download sequence region

Download sequence (13Kb)

Get flanking sequences on SL2.50ch08

mRNA Solyc08g077420.2.1

Ontology terms

terms associated with this mRNA

GO:0004004 – ATP-dependent RNA helicase activity

cDNA sequence

spliced cDNA sequence, including UTRs

>Solyc08g077420.2.1 ATP dependent helicase (AHRD V1 **-* A8NEE6_COPC7); contains Interpro domain(s) IPR018999 RNA helicase UPF1, UPF2-interacting domain
CGATCTCCCTCAACCTCCATACACTGTTAATTCCTTAACTGTCTCCAACAAATCTCAAACAAAAACACAATTTGTTTTCTTCTTCTTACGCGCATTCAAATTCCTAAACCCTAACCCTAACGCTGACGCTGAATTCGTATGTGATTAACGAGTGCTGTCTGTCATCACCAAAAAAATGGATTCTCAGGGGAATAGTTTGTACGACACAGCGTCGCAGCCGGACACGGGTAACGATGTGTACACATTTTTGGAATTCAACACACAGGGAGAAGAATTCGATTATCCTGAGTTTCATGAGCTTTCACAGCCAATTAGATCATCTGCTTGGCCTACACCGTCTGATTCCTTAGTCTCTGAAGTTCCTGATCGTCCGCAGTCGTCGTCTGATGCTTCTCAAGCGTCAGGTAAATCACGTGGCGGTGACGGTGGACGGAGTAGGAGTAGTAGTAGCAGTAAGATTAGTAGTAATAAGGCGGCAGCGGTGGCGGTGGATGCATTGGCGGCAGGGATGAGCGGGTTGAATTTTGAAGAGACTGGTGATGATGAGAATTTTGAGTATGGAAAAGGAGATTTTGCGGTTGAACATGCTTGTAAGTACTGTGGAGTGACGAATCCTGCTTGTGTGGTTAGGTGTAACGTCCCATCCTGCCGCAAATGGTTCTGTAATTCGAGAGGGAATACTTCGGGTTCTCATATTGTTAATCACTTGGTCCGAGCGAAACACAAGGAGGTTTGTCTTCATAAAGATAGTCCATTGGGAGAAACAATTCTAGAGTGCTACAACTGTGGATGTCGAAACGTCTTTCTTCTTGGCTTCATCTCTGCCAAGACCGAGAGTGTCGTTGTTCTCCTCTGCAGGGAACCATGTTTGAATGTTAATGCGCTGAAGGATATGAATTGGGATTTGAGTCAGTGGTGCCCCCTAATCGATGATAGGTGTTTCTTGCAATGGCTGGTTAAGGTTCCATCAGAGCAAGAACAGTTGCGGGCACGGCAAATCAGTGCTCAACAAATAAATAAAATTGAAGAATTGTGGAAGACAAATCCTGATGCTAATTTGGAAGATCTTGAGAAGCCAGGTGTGGATGATGAACCTCAGCCTGTTGGCTTGAAGTATGAAGATGCCTATCAGTATCAAAACATATTTGCACCGCTGATCAAGCTTGAAGCTGACTATGATAAGATGATGAAAGAGTCTCAAAGTAAAGATAACCTCACTGTTCGGTGGGATATTGGTCTCAACAAGAAGCGGGTAGCATATTTTGTTTTCCCGAAGGAAGACAATGAGTTACGACTTGTACCTGGTGATGAGCTACGACTGCGTTATTCAGGGGATGCAGCTCATCCAGCATGGCAGTCAGTGGGGCATGTGATAAAATTAACTGCTCAAGAAGAGGTTGCCCTTGAGCTTCGTGCCAGTCAGGGAGTTCCGGTTGATGTGACCCATGGGCTGAGTGTTGACTTTGTTTGGAAGAGTACGAGCTTTGACAGAATGCAAACTGCAATGAAAACTTTTGCTGTGGATGAGACAAGTGTTAGTGGGTATATTTACCATCATCTGCTAGGTCACGAAGTTGAGATGCAGATGATTCGGAATGCACTTCCTCGCCGTTTTGGTGCTCCTGGTCTTCCAGAGCTTAACGCGTCTCAGGTTTTTGCTGTAAAAAGTGTTCTCCAGAAGCCCGTCAGTTTAATTCAAGGTCCGCCCGGTACGGGAAAAACTGTTACCTCCGCTGCCATCGTGTATCATATGGCCAAGCAAGGCCAGGGTCAGGTTTTGGTCTGTGCACCCAGTAACGTGGCTGTGGACCAATTAGCAGAGAAAATAAGTGCTACTGGACTGAAGGTTGTCAGGCTCTGTGCTAAGTCGAGAGAAGCTGTCAGTTCTCCAGTTGAGCATTTAACCCTTCACTATCAGGTTCGTCATCTTGACACATCCGAGAAGAGTGAACTTCACAAGTTACAGCAACTGAAGGATGAACAAGGAGAACTCTCCAGCGGTGATGAGAAGAAATATAAAGCTCTGAAACGGGCTACAGAGAGGGAGATAGCTCAAAGTGCTGATGTGATTTGTTGCACCTGTGTTGGTGCTGGAGATCCTAGATTGGCAAATTTTAGATTCCGTCAGGTGCTCATTGATGAGTCCACTCAAGCAGCTGAACCTGAATGCCTTATTCCTTTGGTTCTTGGAGCAAAGCAGATTGTCCTTGTTGGTGATCACTGCCAGCTTGGACCTGTCATTATGTGCAAGAAAGCTGCACGGGCTGGGCTTGCTCAATCCCTGTTTGAACGTCTTGTACTGCTGGGTGTGAAGCCAATCAGGCTGCAGGTACAATACCGTATGCATCCTGCACTGTCAGAGTTCCCGTCAAATAGCTTTTACGAAGGTACACTTCAAAACGGTGTAACCATCAACGAGAGACAATCATTAGGCATTGATTTTCCTTGGCCTGTGCCAAACCGTCCCATGTTCTTTTATGTCCAGATGGGACAAGAAGAGATCAGTGCTAGTGGAACTTCCTATCTAAATAGAACTGAAGCTGCTAACGTTGAGAAGCTAGTGACTACGTTCCTCAAAAGTGGTGTAGTCCCTAGTCAGATTGGAGTTATAACACCATATGAGGGTCAACGAGCATATATTGTAAATTATATGTCTAGAAATGGTGCTTTAAGGCAGCAACTTTACAAGGAAATTGAGGTTGCAAGTGTAGATTCATTTCAAGGAAGAGAAAAAGATTATATCATCTTGTCTTGTGTCAGGAGCAATGAACATCAGGGCATTGGGTTTCTGAATGATCCTCGCAGGCTTAATGTTGCTCTTACACGTGCTCGTTATGGAATCGTTATCCTAGGAAATCCTAAAGTGTTGAGCAAGCAGCCTCTCTGGAATGGGTTGCTGACACACTACAAGGAGCATGAATGCTTGGTAGAAGGTCCTTTAAATAACTTAAAGCAAAGTATGGTACAGTTTCAGAAGCCAAAAAAGATCTACAATGACCGCAGGCTTTTCTTTGGTGGTGGACCTGGAATTGTTCCCAGTGATAATTATGGATCTCCTGCCTCATCAAACCCCAATGCTGACAGGCGAAGTAGTCGCTCTAGGGGTTCTTACATGGCACCTCGTCCATCCAATGGTACTCACAGACCTGGTGTCTATCCTTCTGGTTATCCAATGCCTCGAGTTCCCATCTCCCCTTACCATGGCGGCCTTCCCCAACCGTATGCAATTCCTGCTCGTGGTGCTATACAGGGACCTGTTGGAGCTGTACCTCATGTTCCACAGCTAGGTAGCCGGGGTTTTGGTGCCGGGCGTGGGAATGCCAATGCTCCAATTGGTAGCCATCTTTCTCACCAGCAAGCCTCCCAGCAACCTATTGGAAGTCATGGACCTAACTTCAACTTTTCTGCACTTGAAAATCCAAACAGTCAACCATCCGGAGGACCTTTATCTCAGCCTGGATATGCTTCTAATATGGCCGTTCAAGGACCAAGCCAGACATTTCGCGATGGATTTTCAATGGGCGGCATGTCACAGGACTTCTTGGGAGATGATTTCAAGAGCCAGGGATCCCATGTTTCATATCATGTTGCTGACTTCTCTACACAGGCTTCTCAAAGTGGATATGCTGTTGATTATGTAAATCAGGGAGCACAGGCTGGTTTTCCAGGAAATTATTTGAACCGGAATTCACAAGCTGGATACTCACGTTTTGGTTCAGGAAATGAATTTATGTCACAGGATTACATGACTTATGGATCCCAAGGTCTCTTCACACAAGCTGGATACAGCGATCCATCACAAGAGGACAGTTCACAAAACCATTTTGGCATGTCCAATGCAAATCCACTTCACTCTCAGAGTTTACTCAATCCACTGTACTCGCAGCCTTTTGGGCATTACAACACCCAACCATTGAACATGCAAAGTTCCCAACCTCAACAGCCTCAAGCCCCACAAGTCCAAGGCTCACAAAATCAGAAACTCCATTACAACGGTTAAGGACCACCAGTTTGTGGCTTTATGGATTATGGTTTTGCATCCAGCAACTTGGTTTGTGCTGTCATGTTTGACTGTATTTTCTATGTAAGATGGAGTAAGAGTGCTGAAATTCAGGTCAGTTGGTGACAGTATGATGACTCTGAATGATTTGATTTTGAGGGATGAGGTGGAGGAAGGCTCTCTGATAAAGAAAAGCATGGGCAGCACATCCGGTGCTGAGAAAGGTGAAACAAGCTTGAGGTTGTGTGCTGTGCAAGAGAAGGTGACTATTTATTCAGGAGAGAACATTACATGGCATGGAATTAGTCGGAGGGTGCCGGTTGTTATTACAGCCATGCTTGGAAGCTGCTAGCACTATCGTCCTGTACAGGTATTCTGGCAAAAATCAGCATAATCCTTTCAGCTCTTCCTGACATGTAACTAATACTCACTAGTAAGTAGACTATGTGATGGATGTGTTTGTTAATAATGCA

Download sequence (4.4Kb)

Protein sequence

translated polypeptide sequence

Related features

Features that derive from this mRNA

Type	Name	Location	Length	Strand	Phase
polypeptide	Solyc08g077420.2.1	SL2.50ch08:61276958..61289401	1,275	+	n/a

Add items to a list:

Features this mRNA is a part of

Type	Name	Location	Length	Strand	Phase
gene	Solyc08g077420.2	SL2.50ch08:61276784..61289874	13,091	+	n/a

Add items to a list:

Features that are parts of this mRNA

Type	Name	Location	Length	Strand	Phase
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.1	SL2.50ch08:61276784..61277492	709	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.10	SL2.50ch08:61282541..61282663	123	+	1
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.11	SL2.50ch08:61282765..61282836	72	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.12	SL2.50ch08:61283315..61283386	72	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.13	SL2.50ch08:61283488..61283554	67	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.14	SL2.50ch08:61283720..61283862	143	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.15	SL2.50ch08:61284011..61284082	72	+	2
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.16	SL2.50ch08:61284157..61284285	129	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.17	SL2.50ch08:61284952..61285107	156	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.18	SL2.50ch08:61285379..61285492	114	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.19	SL2.50ch08:61285826..61285924	99	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.2	SL2.50ch08:61279540..61279791	252	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.20	SL2.50ch08:61285999..61286076	78	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.21	SL2.50ch08:61286450..61286584	135	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.22	SL2.50ch08:61286908..61286982	75	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.23	SL2.50ch08:61287095..61287212	118	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.24	SL2.50ch08:61287800..61288167	368	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.25	SL2.50ch08:61288256..61288318	63	+	2
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.26	SL2.50ch08:61288390..61288461	72	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.27	SL2.50ch08:61288599..61288730	132	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.28	SL2.50ch08:61288923..61289042	120	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.29	SL2.50ch08:61289261..61289874	614	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.3	SL2.50ch08:61279878..61280048	171	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.4	SL2.50ch08:61280185..61280235	51	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.5	SL2.50ch08:61280755..61280847	93	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.6	SL2.50ch08:61281003..61281098	96	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.7	SL2.50ch08:61281278..61281328	51	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.8	SL2.50ch08:61281455..61281573	119	+	n/a
exon	exon:Solyc08g077420.2.1.9	SL2.50ch08:61281983..61282091	109	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.1	SL2.50ch08:61277493..61279539	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.10	SL2.50ch08:61282664..61282764	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.11	SL2.50ch08:61282837..61283314	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.12	SL2.50ch08:61283387..61283487	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.13	SL2.50ch08:61283555..61283719	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.14	SL2.50ch08:61283863..61284010	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.15	SL2.50ch08:61284083..61284156	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.16	SL2.50ch08:61284286..61284951	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.17	SL2.50ch08:61285108..61285378	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.18	SL2.50ch08:61285493..61285825	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.19	SL2.50ch08:61285925..61285998	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.2	SL2.50ch08:61279792..61279877	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.20	SL2.50ch08:61286077..61286449	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.21	SL2.50ch08:61286585..61286907	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.22	SL2.50ch08:61286983..61287094	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.23	SL2.50ch08:61287213..61287799	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.24	SL2.50ch08:61288168..61288255	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.25	SL2.50ch08:61288319..61288389	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.26	SL2.50ch08:61288462..61288598	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.27	SL2.50ch08:61288731..61288922	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.28	SL2.50ch08:61289043..61289260	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.3	SL2.50ch08:61280049..61280184	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.4	SL2.50ch08:61280236..61280754	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.5	SL2.50ch08:61280848..61281002	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.6	SL2.50ch08:61281099..61281277	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.7	SL2.50ch08:61281329..61281454	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.8	SL2.50ch08:61281574..61281982	n/a	+	n/a
intron	intron:Solyc08g077420.2.1.9	SL2.50ch08:61282092..61282540	n/a	+	n/a

Add items to a list:

Related views

Genetic loci

Tomato locus Solyc08g077420

http%3A%2F%2Fwww.solgenomics.net%3A8080%2Ffeature%2F17910674%2Fdetails feature 17910674

User comments

Please wait, checking for comments. (If comments do not show up, access them here)

Accessions	Seedlots
Accessions		Breeding Program	Seedlot Name	Contents	Seedlot Location	Count	Weight(g)

Attribute	Value
Project Name:
Start Date:
End Date:
Event Type:
Event Description:
Event Web URL: