Clone Read LE_HBa0075G19_SP6_85188

Sequence Read 
Read Class
BAC ends
Read ID
LE_HBa0075G19_SP6_85188
Primer
SP6
ID from Seq. Facility
LE_HBa_075_G19-SP6
Chromatogram
Sequence 
Version
1 (current)
Length (bp)
741 trimmed for vector and quality, 946 raw
Sequence
>LE_HBa0075G19_SP6_85188 (raw untrimmed)
AATAGGGGTTATTTTCATACTACGTTGATCCTATTAATGACAAATTGATTTTCCTGGAAAATCAATTTGTGTCCTGCTAGTGCTGACACTTACCTTTAAA
TTTAAAAATAATATATTTTTAAGCATAAGTACCAACACTAGTTGATCCTATTGATGACAAAATTGATTTTCTTTGAAAATCAATTTGTGTCCACCTAGTG
TTGACACTTAGCTTTAAATTTAGAAATAATTATTTGTTAAGCTTAAGAACCAACACTAGTTGATCCTATTGATGACAAAATTGATTTTCTTTGAAAATCA
ATTTTGTGTCCATCTAGTGTTGACACTTAGCTTTAATTTTAGAAATAATTATTTGTTAAATTTGTAACTATCGTGTTAGTATTAAGGTAAAACTAAACTA
ATTAAACTTAGAAATTTGTTAAGTTATTTGGTAAGTTAAACTTGTAACAATAGTATAAGAAATTAAGTTAAAAATAAGCTAGTTAGAATTAGAAAGTTGT
TAAGTTGGTTAATAAGTTACATTGGTTACTATAGTGTTGGAATTAAGTCAAAACTAAACTAATTAGACTTAAAAATTTTGTTAAGTTGGTTAATAAGTTC
AAGTTGTGACTATAGTGTTTGAATTAAGTTAAAACTAAACTAATTAGATTTAGAAATTTGTTAAGTTGGTTAATAAGTTAAACTTGAAACTATAGTATTA
GAATTTAGTTAAAACTAGACTAATTAGACTTAGAAATTTGCTAAGTTGGTTAATAAGTTAAAATTTGTAACTATCGTGTTAGTATAAGGGTAAAACTAAA
CAAATTAACGTAAAAATTTGTTAAGTAATTTGGAAAGGGAACCTTGGTTAATGAGATGAGAAATTAAGTTAAAGATTAAGCACTTGGAATTAAAAAATGT
TAGGTGGGTTAATAAGTATCATTGGAACTATATTGGTTGCTAAAAC
>LE_HBa0075G19_SP6_85188 (trimmed for quality and cloning vector)
TGATCCTATTAATGACAAATTGATTTTCCTGGAAAATCAATTTGTGTCCTGCTAGTGCTGACACTTACCTTTAAATTTAAAAATAATATATTTTTAAGCA
TAAGTACCAACACTAGTTGATCCTATTGATGACAAAATTGATTTTCTTTGAAAATCAATTTGTGTCCACCTAGTGTTGACACTTAGCTTTAAATTTAGAA
ATAATTATTTGTTAAGCTTAAGAACCAACACTAGTTGATCCTATTGATGACAAAATTGATTTTCTTTGAAAATCAATTTTGTGTCCATCTAGTGTTGACA
CTTAGCTTTAATTTTAGAAATAATTATTTGTTAAATTTGTAACTATCGTGTTAGTATTAAGGTAAAACTAAACTAATTAAACTTAGAAATTTGTTAAGTT
ATTTGGTAAGTTAAACTTGTAACAATAGTATAAGAAATTAAGTTAAAAATAAGCTAGTTAGAATTAGAAAGTTGTTAAGTTGGTTAATAAGTTACATTGG
TTACTATAGTGTTGGAATTAAGTCAAAACTAAACTAATTAGACTTAAAAATTTTGTTAAGTTGGTTAATAAGTTCAAGTTGTGACTATAGTGTTTGAATT
AAGTTAAAACTAAACTAATTAGATTTAGAAATTTGTTAAGTTGGTTAATAAGTTAAACTTGAAACTATAGTATTAGAATTTAGTTAAAACTAGACTAATT
AGACTTAGAAATTTGCTAAGTTGGTTAATAAGTTAAAATTT

Warnings:
  • Not screened for repetitive elements
  • Not screened for chimera
Quality Report
Processed by
SGN
Vector signature
flanking vector not found in read
Quality trim threshold
20.5
Sequence entropy
0.880781
Expected error %
0.33453
Sequence Annotations 
Automatic Annotations
No automatic annotations found.
Manual Annotations
No manual annotations found.
BAC 
Clone LE_HBa0075G19
Clone
Clone name
hba-75g19
LE_HBa0075G19
P075G19
Clone type
BAC
Contamination
none
Estimated length
104,402
Library
Name
Tomato HindIII BAC Library
Cloning host
E. coli
Organism
Solanum lycopersicum (formerly Lycopersicon esculentum)
Cloning vector
Accession
Heinz 1706
Restriction enzyme
HindIII

Other Reads:
1 sequencing reads found