Clone Read LE_HBa0049K02_T7_10083

Sequence Read 
Read Class
BAC ends
Read ID
LE_HBa0049K02_T7_10083
Primer
T7
ID from Seq. Facility
LE_HBa_049_K02-T7
Chromatogram
Sequence 
Version
1 (current)
Length (bp)
801 trimmed for vector and quality, 870 raw
Genbank Accession
Sequence
>LE_HBa0049K02_T7_10083 (raw untrimmed)
TTAAACTGGTCCCGGGGGGACCTCTAGAGTCGACCTGCAGGCATGCAAGCTTACGGTCAATAGAAATCCTAATCTGATAACTCAAAATGCAAAAAAGAAA
ATTAAAAATAACCGACTAAAATACATTGTATTTTTGTTATAAAAAAAAAAGGTATTGCATTTAGATAAAATTTAAAAAGTTGGATGATTTAACATCTCAA
CTATATAGTCAGATTTTTTTATTTATATAACAAAAAAAAAAAAGAATGAGCGGTCAGTTTGCAAACGTGTAGCCTTAAGGACCGAACACCATAAAACTAA
CATGTGCCCTTGGAAGCTCGTCTAATCATATCTGATATTCATATTAAAATTTAATTAACCATAAATTTATATATGTATATTAAATATTGTCGCTCTTCTT
TCTTTTATCGCAAGTACGAAGCATAACAACAATGTTTGTATAACTTAATTTTTAAGAAAACGATCCAATAAAAATAAAAGAGTTTCAGTCATTCATCACA
ATTCATTTTAATTTATGTGTGTTAAAAGTTAGTAAGGAAAATAATATTTCTTTTTATATATATATATATCAATAAACATAATTATTAGTAGTAAATTAAG
GTATCGATTTAAAAATCTATTCATAAGTAGGGATATTAAATGAGCTTGTTAAGTTAAATTTGAGTGAGTTAAAACAAATTGAAATAATTAATGAGTGGGT
TAGTGATGCACACAATATTAATTGAAACAAAAATGTGCTAAAAAGCGGGCCCTAATTTAGTTTTTTCGTTTGTTCTTTTATGATTTTATCGTACTTAATA
AAATTATTATTTTTTATTATTATTTTAAATATAATATCGAATAAAAAATTATTTTTTAAAAATATTTTGA
>LE_HBa0049K02_T7_10083 (trimmed for quality and cloning vector)
AGCTTACGGTCAATAGAAATCCTAATCTGATAACTCAAAATGCAAAAAAGAAAATTAAAAATAACCGACTAAAATACATTGTATTTTTGTTATAAAAAAA
AAAGGTATTGCATTTAGATAAAATTTAAAAAGTTGGATGATTTAACATCTCAACTATATAGTCAGATTTTTTTATTTATATAACAAAAAAAAAAAAGAAT
GAGCGGTCAGTTTGCAAACGTGTAGCCTTAAGGACCGAACACCATAAAACTAACATGTGCCCTTGGAAGCTCGTCTAATCATATCTGATATTCATATTAA
AATTTAATTAACCATAAATTTATATATGTATATTAAATATTGTCGCTCTTCTTTCTTTTATCGCAAGTACGAAGCATAACAACAATGTTTGTATAACTTA
ATTTTTAAGAAAACGATCCAATAAAAATAAAAGAGTTTCAGTCATTCATCACAATTCATTTTAATTTATGTGTGTTAAAAGTTAGTAAGGAAAATAATAT
TTCTTTTTATATATATATATATCAATAAACATAATTATTAGTAGTAAATTAAGGTATCGATTTAAAAATCTATTCATAAGTAGGGATATTAAATGAGCTT
GTTAAGTTAAATTTGAGTGAGTTAAAACAAATTGAAATAATTAATGAGTGGGTTAGTGATGCACACAATATTAATTGAAACAAAAATGTGCTAAAAAGCG
GGCCCTAATTTAGTTTTTTCGTTTGTTCTTTTATGATTTTATCGTACTTAATAAAATTATTATTTTTTATTATTATTTTAAATATAATATCGAATAAAAA
A

Warnings:
  • Not screened for chimera
  • Not screened for repetitive elements
Quality Report
Processed by
SGN
Vector signature
5' read, flanking vector found
Quality trim threshold
12.5
Sequence entropy
0.885433
Expected error %
0.210391
Sequence Annotations 
Automatic Annotations
No automatic annotations found.
Manual Annotations
No manual annotations found.
BAC 
Clone LE_HBa0049K02
Clone
Clone name
hba-49k2
LE_HBa0049K02
C10HBa0049K02
P049K02
Clone type
BAC
Contamination
none
Estimated length
50,965
Library
Name
Tomato HindIII BAC Library
Cloning host
E. coli
Organism
Solanum lycopersicum (formerly Lycopersicon esculentum)
Cloning vector
Accession
Heinz 1706
Restriction enzyme
HindIII

Other Reads:
1 sequencing reads found