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Solanum lycopersicum gene Solyc07g005030.2
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Features that are parts of this gene |
Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
---|---|---|---|---|---|
mRNA | Solyc07g005030.2.1 | SL2.50ch07:52983..79984 | 4,895 | - | n/a |
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![]() ![]() | unprocessed genomic sequence region underlying this gene |
>Solyc07g005030.2 SL2.50ch07:79984..52983 (sequence from reverse strand)
ATGGGGCACTTAATAAAGAAACCCCAGAAGAGCATTTGTGTGTTTCTTGCTCCCACTGTGGCATTGGTGCAACAGGTTTTCTTCTTTCTTATTTTTTCTTAACCTTTTAAATTTTTTGATATCAAGGATGTGAACTACTGTACATTAAATAAAATGGATGAATATCAAATATCTTCCCTACTATTGAGGCTGTATTTGAGAGCTTTAAGCATAAGAGTTTCTGCCAGCTACTTTACATATCCTGTCTTTTCTCCGTCCAATCAAGTATCTTTTTTGATTAATAATTTTATTGATTCATGGGTGGACACCTAAATAAAAGTGACAATTTTATTCTTTGCATCGCCTAAAAAGTATCTTTTTCATCCTTACTTTTGGGCGACCACGTCCATAGCATTGCACATTCTGTTGCTTCAATGGCATCACATTTCTTTCGTCGGCTACTATTCGGATGTCATCACTCCTTTTGTCCAAATGTCGCTCCTTTTGTTTATCATATTTTCTGATAGAAATTATTATGGATTTTGTGGCTAGTATGTAATGAATATTCTTCACACATATATTAACACTAGGTGTTTCAGGCTAGTCAAATTAAATTACGTACATGGATATTTCTGATTTTGCTGAGAACTGGTCAAGTGATTGGCATGAAAAGGCCAACATTTTTGCACCTCAGAGAACAAGAAAGCACACTTTGATTTAGAATGTCATATGTTATGTCTAACTAATTTTCTCTTCATTGAAATTGTATCCTATTAAACTCATTCTGTTTTTCTGTGTGTATTTTTGCTTGTTGGGGCAGGGTGGGGAATTTAAGTGTATCTGCAACTTCATAATATATTGGCCTAAATGTTATTTGCTTTTTCATGTGCTTCTGGAATTGGAAAAGCAAGCCAAGGTCATAGAGGAGTCTATTGACTTCAAAGTTGGAACATACTGCGGCAAATCAAAGCATTTGAAGAGTCACCAAGACTGGGAGAAAGAAATGGAACAGTATGAGGTAAGTCTGCATGATCTTTTTGTCAATGATATACATTATCTCATCAGTGTTATTTGTTTGAGGCAGAAGCTTAGGAATTCTTGATTTACGAACTTCCTAGTAGAGATTTTAGTGCAATTCATAATTGAAATTTGAATACATGATGTAAGGGTGACAAAAAAGCCTGAATAACTGATGTTCACTAAATTATCTCCATATACTTGGAATATCTGTACAGACCTGCAATAAGACACTATCTTTGTGCTGATCTAACTCTTGCAGTAATAAAAACTCTTACTTCCCTTAACAAAAGGAATATTTACTATCTACTTTTCCTTCTTCCTGTGTTAATCACAACATCTGGATGAGATTATACAAGTAATACTTGTATCTTTTCTTTGCCTCTTAAATCTTTAATTAATTAAGGTTTGCAACTTACTGCACAGTTTGGAATATCTTCATCTGAATTGAGTTTTTGAACGCGATAAAATGATCTTATGAAGTGACAAATCTCAGATGTTTGTTTGATAGCGAGAGAATTGGAATGTATATTTTGTGTCTAGCCTTTGAAAGATTGGAAGATTTTATGCTTTATTCTAAGGTATTACTATATTAGTAGCTTCCCATGGTCAATCACTTTTTTTAGTAAAACATTGACAGAGCCGCAGAGGATTGCTACACTTTCATAATGCCTCTAATTCTGAACTTTTACCTGTCAGTCCCCCAACCACAAAAAAGAGCTTTTGAACTTTTTTATCTCCTTCTAGGTGAAAATTCTCCCATTGGAATATTTTTCCAGAATATCTTATAAGGTTCTACTGCTGCCAAAAAATCTTTAGTTGAATGTTTTCTCGTTCCAAAATTGGACTGCATCAGTCATTCTTTTCCAAGTTTCAATCGCTATGAGTATATGCTATTCCACTTAAATCTTCTGAAGAAATATGAAGTGTAGCTGCCCAAGTGGGTGACCTAGTTGGAAAGATGGAGTGACAACCTTGGGAACCAAGATAGAGTGATTGAGCCACGTGTTATATATTGTTGTCTTCTCATCTTAGGTCCTTTCTTTTTTGGACTATGGATGAGAGTGGATATTGCTGACTATTATACTATATCTGTGTTTGCCACTTTCTGAACGTTTTTGACCAACAAATTTGCATGTTGTTTGTTCAGGTCCTTGTTATGACCCCTCAAATACTGCTACATAATCTTTCCCACTGCTATATCAGGATTGAATTTATTGCTCTTCTGATATTTGATGAGTGTCATTATGCACAAGTTGAGAGCGATCATCCTTATGCTGAGATTATGAAGGTAATTAACTGATCTGGTGTTATACGCTGGAAAATATGCTTCTTTTTGTATATTGCAGCCTAGTTATTCATGTGTATTATTCTTGGACAGATATTTTACAAACCTGATGTAGTAAAACAGCCCCGTATATTTGGCATGACTGCATCTCCAATATCAGGGAAAGGTAATATTATTGTGCCAATGAATTCATGCAGTAATAAGATGTCCTAATTTTCTCTAACTAGCTGGATCCATTCAGCTTATAGGTCTTGAGTTATTTGTATGTTGCCTTGTGTTAGAAATTTGAAAAATAGGTTTACATAATAATTTTCGGCAAAATTATGTGTGGATGTCATCCAGATTCCAGAAAACCATTTCTCCTAGATTCATTTCTCTCTTTTTGTTTTTTCAGGAGTCAATTTTTTTGACAATTTCTTACACTCCAAACAAAAAAGTTTTTCCAACTTGTGAGATCTTTAACTATTACTTAGGAGTGATGAATTGCATCTACATCTCTTTTCCATGTAAAATTGATCAAATAGAAACTGAAAATTGTATATAATCATTAACATATGGTTGTGATGTATGGTACCTCTACTCCATTTTGGCTGTACTTCGGACTTACAATATTAACCTGATCTTTTCTTTTCAAGAAATCTCCAAGTATCTCTTTTAGATGTTACTTTATACTCATTGATTTTGGAAGTACCAAATTGGGGACTGCTTTGCTGTTCATCATTGACAGATAAGCTACAGTTCATTGTGGTTGTCTCATTTTAACCTTTTATGACTGAAAAGTGTCTCTATGTCTCTTATCTCAGATGGTTAAAATTTTACCCCCTTACATATGACAATATGCATATATGTAAATGATTTCTGTTTGGAGAAAGTTATGACTTGTATGAATTCTATTTAAAAATGGGATCAACAGAAGTTGAAGGAGGTATTATCAGAAAATAAGTTTGAAAATGAGTGCAGGTTTTCTGATTTTCTGACTTATTAAAAACCTCACCTGATATCTGTGTTATGTGGAATGAAACCCTGCTTTCCATGACATGCATTGATCAATTGTGGTAACGGATTGATAGTTCTTGCTATCTGATCTTTGTTCTCAATACTGATCATTCTGCCAGGCGTAATTGGTATATCTATCCTTTAAGCTACTTTTGTTGTTTGGACACTCCTCAGCTCTCAGACATTATGTTATATTTTTACCATTGCAGGTGCTACTGTTGAAGGCCTTGAGACCTTACTTCGTTCTAAGGTGCTACTATTATATACAGAAACTATTTTTTATGAACTATCAAATAATTTTACTTTTTTCTTATGAAAGAAATGAAGTCCAAAAGAAGTTGCTTGTGAAGGATGGATTTCTGTCATAGGTTTATTAGTTCTAGGATTTGCTAATAACGGTCTTAAGATTTGATTCCAATTTCCGTAGCTATCATTTTGAATCCTAGGTCTCTCGTTTTTGGGTATTTTATTGTTAGGTAACAAAGGACGTCTGCCAAGCCTGGCAGCATTTACCTACTTGGCCTGGCTGGGCTTAGCTACCATCCTTTGTTCATGCCTATACTGGTTTCATCTTCACCATATTTCTCCTTCTTGGCTGCCCAAGTCCAACTAGTGCTCACTATCTCAAGGTCCTACCTAGACTGATTTGGACTTCTTCCCGTTTTGTGTTTGCAGAAGGGGGAGGTAGAGGAATGGAGGAACATTAACATTCGTATAGTTTAATTTTTCGTCTATATATAACCACAGGTGTATTCTGTTGAAGACAAGGACGAATTGGAACAGTTTGTTGCATCACCCAAGGTGAATGTGTACCAGTATGGTCCTGGCTCCTCATGTCATACGAAGGCTTATTCTCAGAAGCTTGAAGAGATAAAGCACCAGGTATTATCTGGTCAGAAATTAAGATGACTATTTCTAATAGTCTTTGACTTAATACTCTCTGGTGTATTCATGATTTGACAGTGTGTAAAGGAGCTTCACAAGAAGGCAGTTGACAGCACTCTCAGGAACACAAAAAAGATGCTCAAGAGACTGCATGGACATCTAATTTTTTCTCTGGAAAACCTAGGTGTTTTGGGGGCGTTACAGGTTTTGTCGCACTTCTTGTAGTTTATCCCCCAAGACCCATTTCACAAGCCCTGATCTTTCATATTTCTTTAGTTTTAAAAATAGAATCAGAAACTTTATTGAGCTCATTTACACATGTTCCCAACTATGTTTGGTAAAAAAGGAGCAGGGGAAGACCTGGCCCGTGTTGCCACATCACCAACAGGCAATCAGTATAAATTGTCTTTTGACTTGAGTGCAATTTCAGACACATGCTATATAGTCTCAACACTTGACTAGACTCCTCGGCACTCTGCAAAACTAAAATAAGAGTGCGCAGACGGGTTTGAAAAGTTTCAGATACAAGTTAGTGCTGCCAGATTGTGCACTTTAGATTCTCTTGACCTGACATAGAATTTTTGGCAGATAGGTGTAGACCCTTCAGTTTTTTGTATACGCATGTGTACTTTTTGTGTATCCCACATGCATTGCCGTAGTTATGATATTACAGCTTTTTTCTAACTTAAAGAGTCATTAATTTTAGTAGAATATGACACTGAATGAAAATCTAGAATCATGTTGGGTTCCATAGTCATGATAAACATAATTTGAGAACTTCTAATTCACAGGGAAGAAATCACGATTTATCTTTTTCTAACATTTGAGATTTACA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Download sequence region |
Get flanking sequences on SL2.50ch07
|
![]() ![]() |
![]() ![]() | terms associated with this mRNA |
![]() ![]() | spliced cDNA sequence, including UTRs |
>Solyc07g005030.2.1 Ribonuclease 3-like protein 3 (AHRD V1 *-*- RTL3_ORYSJ); contains Interpro domain(s) IPR000999 Ribonuclease III
ATGGGGCACTTAATAAAGAAACCCCAGAAGAGCATTTGTGTGTTTCTTGCTCCCACTGTGGCATTGGTGCAACAGCAAGCCAAGGTCATAGAGGAGTCTATTGACTTCAAAGTTGGAACATACTGCGGCAAATCAAAGCATTTGAAGAGTCACCAAGACTGGGAGAAAGAAATGGAACAGTATGAGGTCCTTGTTATGACCCCTCAAATACTGCTACATAATCTTTCCCACTGCTATATCAGGATTGAATTTATTGCTCTTCTGATATTTGATGAGTGTCATTATGCACAAGTTGAGAGCGATCATCCTTATGCTGAGATTATGAAGATATTTTACAAACCTGATGTAGTAAAACAGCCCCGTATATTTGGCATGACTGCATCTCCAATATCAGGGAAAGGTGCTACTGTTGAAGGCCTTGAGACCTTACTTCGTTCTAAGGTGTATTCTGTTGAAGACAAGGACGAATTGGAACAGTTTGTTGCATCACCCAAGGTGAATGTGTACCAGTATGGTCCTGGCTCCTCATGTCATACGAAGGCTTATTCTCAGAAGCTTGAAGAGATAAAGCACCAGTGTGTAAAGGAGCTTCACAAGAAGGCAGTTGACAGCACTCTCAGGAACACAAAAAAGATGCTCAAGAGACTGCATGGACATCTAATTTTTTCTCTGGAAAACCTAGGTGTTTTGGGGGCGTTACAGGCTAGTTGCATTCTCTTAAAGGGGGATCACCATGAGCGCCATCAAATGGTGGAAGCTGAAGTTAATGCTAGCGATGACTCTTTGTGTGACAGATATCTGAGTCAGGTTGACACAGTCTTTACTTCTGGTTGTGCTAAAGATGGTATGAATCCTGATTTGGCACTCATGGAAGTTCTGAAGGAGCCTTACTTTTCCAAAAAGCTTTTACGCCTAATTGGCATCCTTTCCAACTTTGGGGTACAACCAGATATGAAATGCATAGTATTCGTTAATCGGATCGTGACTGCAAGGTCCCTTTCGTATATTCTTCAGCATCTGAAAATTTTATCTTCTTGGAAGTGCGGGTTTCTTGTAGGTGTCCACTCGGGATTGAAGAGTATGTCACGAAAAAATACAAATATCATTCTCGATAAGTTTCGTTCTGGTGAGCTCAATTTATTGATTGCAACCAAAGTTGGCGAGGAAGGACTTGATATCCAGACATGCTGCCTCGTTATACGATTTGATCTTCCTGAAACTGTTGCCAGTTTTATACAGTCTAGAGGGCGTGCCCGCATGCCAAAGTCTGAATATGCATTTTTGGTTGATAGAGGTAACCAAAGGGAGCTTGATTTAATCGAGCATTTTACAAGAAGTGAAGCTCAGATGGATGATGAGATCTCTTCCAGAAAATCTCGCACAATGGTGGCAGATTTTCAGGAAAATATATACAAAGTAGATATGACTGGTGCAACCGTCAGTTCTGCATTAAGCATTTCATTGCTTCACCATTATTGCTCCAAGCTTCCACACGACGAGTATTTCTGCCCCAAGCCGCAGTTCTATTACTTCGATGATGTAGATGGAACTATTTGCAAATTAATTTTACCTTCAAATGCTGCGATGCATTCAATTGATAGTGCTCCTCAATCTTCTATAGAAGCAGCTAAGAAAGATGCTTGTTTAAGAGCCTGCAAGAGCTTGCATGAACTTGGAGCACTCACTGATTATCTTTTGCCTGATCAAGCAGACGAAGATAAAGACCTGGTCCCCGATTTTTCTGACTTGGAATGTTGTGAAGGCGAAGATGCACGGGAAGAGCTCCATGAGATGATTGTTCCTGCTTCCCTTAAAGAACCATGGACTGAGACAGATAATCCTGTTTGCCTTAACTCGTACTACATAAGCTTTTTTCCATTCCCTAATGATAGGGTGTATAAGAAGTTTGGCCTATTTCTGAAAGCACCTCTTCCCCAAGAGGCTGAGAGAATGAAACTTGATCTCAACTTGGCTCGAGGTAGATCTGTGAAGACAGAGCTTATTCCATCAGGAACTACTAGTTTTGAGAACAATGAGATACAACTAGCAGAGAAATTCCAGAGAATGTTTTTCAAGATCATTCTTGACCGCTCTGAGTTCATTTCAGAATTTGTGTCTTTGGAAAAAAAGGATTTTGTCGACTCAGGTTCAAAGTTTTACCTATTGCTTCCTGTCAATTTATTTGGGCATGATAAAATCTCTGTGGACTGGGAGCTTGTCAGAAGGTGCTTGTCATCACCAGTTTTTGGAACTTCAGTATGTACTAGCAATAATATGTCTAAATTCGAAGAGCAGTTGCAACTTGCCAATGGTTCCAAAAGCGTACATGATGTTGTCAATAGCTTGGTATATGTTCCATGCAAGGATGCATTTTTCTTCATATCTGACGTTGTTAAAGACAAAAATGCATACAGCATGTATAAAGATTCAAAAAACCACGTCGAACACTACTATGACACTTTCTCTGTCCATCTTTTATACCCCGATCAACCACTTATAAAAGCAAAACAGCTCTTCTGTTTGGAAAACTTACTACGGAAGAAAGGCTATTCAGAGTTGCGTGATAAAGAGGAGCACTTTGTTGAACTACCTCCTGAAATTTGCCAGCTCAAGATAATTGGGTTTTCCAAAGATATTGGGAGCTCATTATCATTGTTACCATCAATCATGCATCGCCTTGAAAGCTTACTTGTCGCTATTGAACTGAAGGGCTGTCTATCTGCTTCTTTCCCTGAGGGGAGGGAGTTAGCAATAGATCATGTTCTTGAAGCACTCACTACAGAGAACTGCCATGAGTCCTTTTCTCTTGAAAGGCTTGAGGTGCTTGGTGATGCGTTTCTCAAGTTTGCAGTTGGGAGACATCTTTTTCTTTTGCACGATGCCTTTGATGAAGGACAGTTAACTAGAAAGCGCTCAAACGCGGTGAACAATTCCAATCTGTACATGGTAGCAATCAAAAAGAATTTACAGGCATATATACGTGATCAATCATTTGAACCCGACCACTTCTATGTAGTAGGGCGTCCGTGTCCTGTAACCTGTAACAAGCAAACAGAAAAAAACATACATGGTCTGTGTGGTAGCGGAACAGATGGTATAAAGACTGAAGTTAGGTGTAGCAAATATCATCACTGGCTGCGTAAGAAAACAATTGCTGATATAGTTGAAGCCCTTGTTGGTGCTTTTGTAGTGGACAGTGGCTTCAAAGCAGCAATTGCATTTCTTAAATGGATTGGTATCCATACAGATTTCAAAGAACCACAACTAAAAAGTATCTGCTCTGCAAGCAAAGTCTTTATGCCACTTGCTGATGAAATAGATGTTCTTGGCATTGAACGTTTATTAGGTTATTCTTTTATCCATAAGGGTTTGCTTATTCAGGCATTCATACATCCATCTTATAACAGGCATGGAGGGGGTTGCTATCAGAGATTGGAGTTTCTTGGAGATGCTGTCCTTGATTATTTGATCACATCTTATCTGTACTCTGTGTACCCAAAACTGAAGCCTGGCCAGTTGACTGATCTGAGATCAATTTCTGTAAACAACAATACCTTTGCAGTTGTTGCAGTACGTCAAAGCTTCCACAGTCATATACTTTGTGATTCTAGCGACCTCCGTGAGTCAATTACTAGATATGTAAATTTCATTGGCAGACCAGATTCTACGAGAAGGCTGGGTGAAGAGCCATCTTGTCCGAAGGCCCTCGGTGACTTGGTGGAGTCTTGTATGGGTGCAATCCTACTTGACACAGGGTTTGACTTGAACCGTGCTTGGCAAATTATACTCTCCTTCTTAAAGCCCGTCATGAGCTTTACCAGGTTGCAACTTAATCCGACAAGGGAACTCTATGAACTTTGTCAGTCTTTTGGCTGGAATTTAAAGTTCCTGCCGTCAAAAAAAGATGGCAATTTTCTAGTTGAGGCCAGGGTAAATGGGGAGAATGTTTCTGCAGCTGCTTCTGCTCTCAATATTAATAAAAAATCTGCTCAAAGAATGGCTGCACAAATAGTATGCTCAAGCTTGAAGGCTCAAGGCTACAGGCCCAAGTCTAAATCACTGGAGCAAGTGCTGAAAGCAGCTATTAAGATGGAAGCTAAACTGATAGGATATGATGAAACACCCTGTGTTCTTACTACTATTTGTGATGACTTGGATAAGCATGAAACATCTGAAAGTGATTGTCACTTGAAAGTATTCCCCGTTAATGAGGAACTTGCAAGAAGTTGCAATTTCAAGTCTAAGTCTACGAGAAAGTTGTTGTCCACAGAGGCATCTGTACAATGCAATTCTGACCAGACCATCATGAGTAATGGCTCTAAGGAAGATGCAAAAGCTACAGGTGGTTCAAAAACTGAGTCGGCAAAATCACGTTTGCATGAAATTTGTGCTGCCAACTGCTGGAAACCTCCTTTATTTGAATGTTGCAAGGAAACAGGACCAAGTCACTTGAAAGAGTTTACTTTCCGGGTGTTGGTAGAGATTGAAGAAACATCAAGAGTTATAGAGTCTTATGGAGAAGCTCAAGCGAAAAAGAAAGATGCAGCTGAGCATGCAGCAGAAGGGGCTCTTTGGTTCTTGAAGCAGGAAGGATATCTGCTCGACAACTGAGTGCGCTTCCACTAATTTGAGTGTAATTTACAAAAAATGCAATTAGGCTGTTTATTGCAACGATAATGTGGCTGTATGTCAATTCTGTGTATAGTGCATAGATGTTGTATATTATTGGAAGAGGTCGTAGAGCGATTTAAGGGTTCTTTAAGCTCTCTCCCTGTGTGATTGCAAATAGAATAGGTGCTAAGTGATGTAATTTAACATATAGTTGGGAAGGTACATAAGGTCTTGAAATGATAATGTGGCCTGTTATTGGTGTGAGGTGAAGTTTCATATTTTTG
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![]() ![]() | translated polypeptide sequence |
>Solyc07g005030.2.1 Ribonuclease 3-like protein 3 (AHRD V1 *-*- RTL3_ORYSJ); contains Interpro domain(s) IPR000999 Ribonuclease III
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Features that derive from this mRNA |
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polypeptide | Solyc07g005030.2.1 | SL2.50ch07:53266..79984 | 1,537 | - | n/a |
Add items to a list:
Features this mRNA is a part of |
Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
---|---|---|---|---|---|
gene | Solyc07g005030.2 | SL2.50ch07:52983..79984 | 27,002 | - | n/a |
Add items to a list:
Features that are parts of this mRNA |
Add items to a list:
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- Genetic loci
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