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Solanum lycopersicum gene Solyc05g050680.2

Name Solyc05g050680.2	Type Gene	Organism Solanum lycopersicum
Synonyms / aliases Solyc05g050680	Length 9,134

Description

Casein kinase II subunit beta-4 (AHRD V1 **** B6TGH2_MAIZE); contains Interpro domain(s) IPR000704 Casein kinase II, regulatory subunit

Location(s)

SL2.50ch05:60797944..60807077

GFF source

ITAG_eugene

From BOGAS: 1

Length: 9134

Genome Viewer

Related features

Features that are parts of this gene

Type	Name	Location	Length	Strand	Phase
mRNA	Solyc05g050680.2.1	SL2.50ch05:60797944..60807077	1,508	-	n/a

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Genomic sequence

unprocessed genomic sequence region underlying this gene

>Solyc05g050680.2 SL2.50ch05:60807077..60797944 (sequence from reverse strand)
GAAAAAAACAAAGGTGGAGAAAGAAAACAAAAGATCTAACAATAACAAAATCAGAAAAAGGAGAGAGAACCCCATAGAAGTTCTCTGTGTCTTCTTCTATCACTTTCCGCTTTTGAAACCCTAATTATCTTCCTCAACCCGACTCACCGTTTCTCAGTTTCAATTTCTCTCCAATTTTCCTTAACTTTCTGTAATCTCCTGAATGCAGATATAGATATATAGTAGCAAGGTTTGATAAATACTTGATAGAAATGTATAGAGATCGAGGAGGTGGCGGAGGAGGAGGTGGTGGTTCATCGAAGTCGGAGATGATCGGTGGACCGTTGGATCGGAAAAGAATCAACGATGCGTTGGATAAGCACTTAGAGAAGTTGTCACCTTCTACATCTAGGTCTTTGAAGGATAAAGCTGTTCCCTCTACGTCAACCGGTGGTGGTGGTGGTGCTGGAAAATCGCATTTTGATCATCGTAATACCAACAAAAACAAGTGCTCCGATGGTTAGGATTTTCTTTTTTCGCCATTAAATATTTTCCATTTTTTGAAAGCATTGGATTTTGTTTTTATCGGGTTAAAACTGTAGTATTTTGTGATTAGCTATTGATATCATTTCTGCAGCTGCTGGTAGAATAGAGGATCCAGCTGTTTTGGTTTAACATGTTTTAATAGAGATGTGATTTTGGGAGTAATTGCTGGAGATGAGCATAATAGGATTTAGTTGTGATTAGCTACTTCCTTGTTTCTTCAATTTGTTTGTCTTGCATTCCTTTTTAAGTCCGTTTCAGAAACTTGTCTGTTAACATTTTTGTCTAATCTTTAATTTCAAATGACACGTTTAAGACGACAAGATTAAACTATATTTTGAGTTCTTTCTATGTATTTTTAGTTTAAGACTATAAGATTAACAAAAAGTTGTCTTTAGTTTCTTAAACTCTATGCCAAGTTAAAGCGAGACAGGCAAATGAAAACAGGGGAGTATGTAGTTTCTTCTTCTTCTTATGTTTTTTTATATAATGGTTTTCAACTGCTGTTGGTCATGCTTTGAAGCAGGAAAGATATATCATTTGCTTTTATTGCGGCTTTGGCTGTAAAGTATTTTTGGAGCTTAATCCACTTGCCTTTGCAGTGATATGAAATTATTAGAATTTATGAGAGCTTAATCCATCTTTGGTGTGTTTTAGTTGTTCTTATAGTAAAATTGCTTTCGTTTCCGGTTTCCCCTATTTTTTAATGATGCAATTCTTTGGAAGTAATTGCAATGTTCCTTTTATCCAAAAAGTATCATGAAATGAATTTCAGATAAAGCTTTATCAAGTGCTAAAGGGTGAACATGGATGAATGAGTATGGCCCGAATCTGCTTATTTTGTTGCTTGTTCTTTGTGGATGTTTCCAAATTGAATTTCTGATATTCTCAGATTCTCAACATGAAGAAATGCAGATTATCCTTGTGGAATCATATGTAATTTGCTTGGTTGTACATTGTCAATACTTGTTAGTGGCTTACAAAGTTGAGTTCTTTTTTCTAAAATAGTTTGTGTTGTGATGTGCAATCATAAGTTCAGGCCAGACTTTTGTGGTCATTTTATGCTAGTACTTGTCAATATATATTGCTGTAGTATCAGTCAATTGTACTCTGGGATAGAAGTTATGAAGTTAAAATTGATATTTTTATATGGTATATTGCCCTTGCTAATTAACACTATCTGTATTATTTATCCTGTTTCAAGTCAGGCTTAATGTTTTGATTGTTAAAAACCTTTAGCCTTTCAAGTAGAATAACTTGATCTTTTACTTATAGTTGGTTCTTGTGTTGGGTTGTGGAAAGCATGTCACAACTTTTTTTTTCTCAATAAAATACGTAATTTAGTCTTCTCGAGGTGCTACTTTTTCGTGGGGTATAGTGTGACATACTATGCCAACCCATAATGCACTACCATTGAATTTCAAAATCTACAAGAGTATAATCTCATTTTTATCTACTTTGTAGAGGAATCTGAAACGGACAGTGAAGAGTCTGATGTTAGTGGTTCTGATGGGGATGATACTTCATGGATTTCTTGGTTTTGTAACCTGCGTGGTAACGAGTTCTTCTGTGAAGTTGATGATGATTACATTCAGGATGATTTTAACCTATGTGGATTGAGCAGTCAAGTTCCCTACTACGACTATGCACTTGACCTCATCCTTGATGTTGAATCCTCCCATGGTACATATTTTTTCTCTTATTTAGATTACTTCATATTTTGTTATGAAATTCCAGAGAATTAATTTTGGACTTATCTTTACATTATATTGAAGGATAATTTTCTCGTCTTTGAAACTATTGGGTTTATTTTTATTTTTTTTGGTTTCTTATGGACTATATCCACAAATTAGTACCTAGTGAATGGAAGATGCGGAAAACTAGTTAGTTTTACTTGATATGTTCTAGCTTCTAGGTTGATTAGGATGACAAGTTCTTATCAGTGTTGTGAAAGGCGCTCGCCATAGCGCCTTTGGCGAATGGCGAGGTTGTGTCACCATTATCCACTGAGGTGAGGCGACCCAATGACGACGTAAATGGCGTCACCGTTTTGATTTTTTTAAAAAAGTTTTAACTTAATAATATTAGTTTTTTTTTTCTATTTTCAAACTTTCATCAGACTTTCGTGTATTCCTCTTCTTCTCTTCCTCAGTCGCTGCTCGCTTCTTCGTCTCTTTCCCTCAAGTTGCTGCTCCATTCGTCTCTTTCTCTTTCACTCTTCGCTGTCCTTGCCTTCACTACTCTTTTTTTCCTCTGTTTTCTTCACTCTTTGTTTTGTCCCGGATTATTGTAAAATGCTTTCTGCTTTCACTGTGTTGTGACTGCTGTCCATTATTTTTTTGAAAAAAAATTAATTCTTCTATTATAATTATTATAGTATTTGTAATATATGTAATTGCTATTGAAATTTTGAATTTTATATGTGCAATTAAATGTTTTTAATTTTTGGTATTAATTGGCGCCTCGATTCAAAAAGGCGAGCGCCTCGCCGCGTGGTGAGGCAGGCCCTTGTCGCCTCTCGCTGTCCAAAACACTGGTTCTTATATAGGCTGGGAGAAATTATTGAAAGTTAATTTTGGGTCAAGTTCATGCTCTCAAAAATAATAAAATTGAATAAAATGAGTAACTTCCTATCACGATCCAAACCCTCCCTTAGCTATGATTGACTATCCGAGTCTAGGCAAATCAAAACATTTATTACCCAAAATCTAATTATGCGGAAGCATTACTAATAAAAGCTAACAATCGACAAAGTCATAAATGAGAGATTTAATACAACATGGAAGCCAAATTAAAAGCACATAATTAAATTTTCTTGAACTAATGTTACATTGTCATGACTCATGAGCAAACTGAAGAGAAAGGTACAATTTTCTCAACTAGTACATAGTTCGAAAATAGAGAAGTCAACAACATAATGACATGAAAGCATGTCATGACCACTGTGGTAGAAGGCAAACGATACACTACTGAAAAACTGGATCACAACTGGAACTCACTCGCGTACCATGTTGGTAATGTGATCCGAACTTGTACCAAAAAGTGTAGGAAGTGTAGCTTGCGTGTGAAAATCAATGTATACCCAATAAGTCTCATTGACTGCTCCCACAGAGTATGAGAAATATTACTTAAAAAGACACCTTTACCTTTAGTTTATGCAATTTAGGTGGGACATATAAGGGAATGAGCAATTAACAAGAATATAGGCATGAATAGCCAATTAACAACATTTAAGCATTTATCGCAATTCAAACCAACAGAATAGAAATGTTCGATACATATAACGGAATCAAACAAAGTTAAATAGTCAAAGAAGGCGGTAAAGGTAAAATCTTTATCACATAATTTACTTCTCAACTCAGTTGGCTAACTCTTTCATGGTTAGCGTGTACACCCCTAGGGAAGTACCAAGTCGTTGATTCATAAGCGACAGATTCATATCCACACACATATGATCATATCAATGATTTTTTTTGTGAAACTAAATGATCATATCAAACGATCTTACATACCCAAATAGTCCTTCATGTTACTTTCACAATCCAAACTCAATAGTCCCCACATCACATGGTCCCTAATTTGTCACAAGTAAGTTGTACAACTGTATCAATTTCATATTAGGAGCTGAAAAGGAAATCAGTGTACACTACATAGATAAAGCATGAATTTCAACAGATATGAAGATAGAAGTTAGAACATGCTTTTCTAGTGTTTTTTTGCATAACCGAGAAATTCGTTTGTGACCCACCCTTTTGACCAATCACAACCTTCTAAACTCGGTGGATAATGGGCTTGGCCCTCTACCATTGGCTTCACTTTGCATGGTGTGGGGCTTGAACTTGCAACCTAAGTCACAGATCCTCCACCTTTTGCCGCTCGAGCTAGGCCTTGGGAGCGCTTTACTAGTATTTAACTAGCCCAACTTCAACATGACATATATATATATATATATATAATGCTCAACTCATCAAAATGTGGGTATGGGTACGAAAGCAAAAGCCTAGCATTTCAAGTATCCCCTTTTACAACTGATAGTTGTATATATACGTGTCATGCCATGCATAAATTATCGCTACACATTACAAGTCATGAATGACACATAAATTGGGAATTATTACCCTATTGACAAAAATGGCTCGACTTAACTCGATTAAAGCAAGCTTTCAGCCTTTTATGACCTCCTTTCCACACCCAAACATGTCCAAATGGCTCAACTCTAGCCAAAAGAATGTTCAACAACGTCAAACAAAGATAAGAATCTATTCCCATAATTTAGTACATGGTCTAAATTAAAGTTAATAAAATTTGAACTCAACCCTCAGGGTCAAAATCCAAAATTTATTTGAAAATTAGTTGCCCGGAAGTTCCCGAGTTCAAATCTGTAATTAGATTCCCAATTCGACATACCTTCAAATCCTAAAATGCACATTCTAGAATCTAGGACAACATCCCTCCATTGGACACTTCAAAATCAATGA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Download sequence region

Download sequence (9.0Kb)

Get flanking sequences on SL2.50ch05

mRNA Solyc05g050680.2.1

Ontology terms

terms associated with this mRNA

GO:0019887 – protein kinase regulator activity

cDNA sequence

spliced cDNA sequence, including UTRs

Protein sequence

translated polypeptide sequence

Related features

Features that derive from this mRNA

Type	Name	Location	Length	Strand	Phase
polypeptide	Solyc05g050680.2.1	SL2.50ch05:60798342..60806826	286	-	n/a

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Type	Name	Location	Length	Strand	Phase
gene	Solyc05g050680.2	SL2.50ch05:60797944..60807077	9,134	-	n/a

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Features that are parts of this mRNA

Type	Name	Location	Length	Strand	Phase
exon	exon:Solyc05g050680.2.1.1	SL2.50ch05:60806580..60807077	498	-	2
exon	exon:Solyc05g050680.2.1.2	SL2.50ch05:60804873..60805091	219	-	2
exon	exon:Solyc05g050680.2.1.3	SL2.50ch05:60798967..60799061	95	-	n/a
exon	exon:Solyc05g050680.2.1.4	SL2.50ch05:60798671..60798836	166	-	2
exon	exon:Solyc05g050680.2.1.5	SL2.50ch05:60797944..60798473	530	-	n/a
intron	intron:Solyc05g050680.2.1.2	SL2.50ch05:60805092..60806579	n/a	-	n/a
intron	intron:Solyc05g050680.2.1.3	SL2.50ch05:60799062..60804872	n/a	-	n/a
intron	intron:Solyc05g050680.2.1.4	SL2.50ch05:60798837..60798966	n/a	-	n/a
intron	intron:Solyc05g050680.2.1.5	SL2.50ch05:60798474..60798670	n/a	-	n/a

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Genetic loci

Tomato locus Solyc05g050680

http%3A%2F%2Fwww.solgenomics.net%3A8080%2Ffeature%2F17829141%2Fdetails feature 17829141

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Accessions	Seedlots
Accessions		Breeding Program	Seedlot Name	Contents	Seedlot Location	Count	Weight(g)

Attribute	Value
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