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Solanum lycopersicum gene Solyc04g076960.2

Name Solyc04g076960.2	Type Gene	Organism Solanum lycopersicum
Synonyms / aliases Solyc04g076960	Length 6,960

Description

Sucrose transporter (AHRD V1 **** Q9FVJ6_SOLLC); contains Interpro domain(s) IPR005989 Sucrose/H+ symporter, plant

Location(s)

SL2.50ch04:61903881..61910840

GFF source

ITAG_eugene

From BOGAS: 1

Length: 6960

Genome Viewer

Related features

Features that are parts of this gene

Type	Name	Location	Length	Strand	Phase
mRNA	Solyc04g076960.2.1	SL2.50ch04:61903881..61910840	1,750	-	n/a

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Genomic sequence

unprocessed genomic sequence region underlying this gene

>Solyc04g076960.2 SL2.50ch04:61910840..61903881 (sequence from reverse strand)
AAAAAGTGTAAAGCAATTTTAGGCATATATACCAACCTACATATTCCCCCTCGTGCCTTTAGCTTAATTACAACTCTACCCCGAGAATAATCTATTTTTCTGCTCACTGTTCTCAATATATCTCGTAATTTCACCAATCTTCAAGGGCATTTTCAGCACGTCCTCCCTCTTCCACCACCTCGCCACCTTCTTCCTCCAAATTCTCCATTAACACACATCAATACGTTGACGTTTTGATATTTGAACGATGCCGGAGATAGAAAGGCATAGAACAAGGCATAACCGACCGGCGATTCGAGAACCGGTGAAACCGAGAGTACCACTGAGACTATTGTTACGAGTAGCTTCGGTTGCCGGTGGAATTCAATTCGGTTGGGCGTTACAACTATCGCTGCTCACACCTTATGTGCAGGAGCTTGGAATACCGCATGCTTGGGCGAGCATAATATGGCTCTGTGGACCGCTTTCAGGTTTATTGGTTCAGCCTTTAGTAGGTCACATGAGTGACAAGTGCACAAGTCGGTTCGGTCGTCGGCGTCCGTTTATTGTCGCCGGAGCAGCATCTATCATGATTGCGGTGTTGATTATCGGTTTCTCCGCTGATATTGGATGGCTTTTAGGTGATCGAGGTGAAATAAAAGTGCGTGCTATAGCGGCGTTTGTTGTAGGGTTTTGGCTTCTCGATGTTGCTAATAATATGACTCAAGGACCTTGCAGAGCTCTGCTTGCTGATCTTACACGTAAGCTTTTCAATTCAATTTTACAGCTTGATTTTCATTTTTTCCCGATTTGTTTATTGCTTGTGAATTACTCTGCTTCTGCTGCTTCTTTTTTACGCTGTTCAATAGCTTAAATTGAATTAACCAATCCACTGAGCTATTAAGATTTAACCAATCCACTGAGCTATAAAGATTTCGCTTCACCTGTAACTTATCATTTGATGAATTTAATTGTTTAGTGCTTTTTGAGGAAGATGAAGCTTCAAACATCTTCGTCAATTATCTAATGGAATGTTTAGCTTTCTTCAGCACTACTCCATAAGAAATGGAAATGCAATAGATGTGTTGTTCTACTTTTTTTGTGACGGTAAAAAACGTATGAGGCGCACTAGTTCAGCTCAAGTAGACAGAAATATCCCGGCACCGATAGTGCAGTGGGACCCCCTCTGTATCCTAAAATTCTCTCATTCTCTCTCTTCTCTTTTTTACTCCTTTTAATTAAATATTAGTGGCTGATGTACACCTAACTGAGTTGAGCCATTACGATCATGGGGGAGCATCGTTAGACTATGTTTTACATTGTTATTAAAAAATTCTTATTTTTTAAAAGCATTTTCTTAAAATAGCTTTTCGTAATTGAACAATAATAATAATTTGTGTTTAGTTAATTTATTTGAAAATTGCTTTTGATAAGCACATTGTGTGTAAGTAATTTTTTTTTTTAAAAAAAAGTAATTTTGAGAATCAAATTATGAAAAAAGGACAAATATTAATGAACTTTTAATATTAAGATTATTTATAGAGAGACATTATTTTAAATATCTTTTATAAATTTTTTTAAAATTTTTATTATAAAATGTATATATTCAAATTTTCAATCAATATGACACAAATAAAAAAGATAAATTTTGATAATATTAATATGATGTATTTATAATTAAAATAAAAATATCAAGCAAAATAAATTTTAAATTATTTCACAAATTAAATCCACCAAAAAATAAATACTCTTTGTCTCTAATGACTTGTCTACATTTCCTTTTTTAGTTGCCCCTAATTATTTATTCATTTTGACAAAGAAAGCACAATTTTTTTCTCCCCTCAATTTATTACTTTGAAAAATGTAGCACTTCTTGAAAATTGTAAGTTTTTAAATCATCCATTTCATAATTAATAGAGATAAAAACCTAAACTCACGATATCAATTATTGTTTTCTTAATAGGTTAGTCAAGTCAAAAGTGGATAAGTGATTAGAAATATAGCACTAAATATAAGGGATATATTGATAAATATTTTTATATGGTAGGGATATGTTGATCTTAAAAAATATAATTTTCTGCTTCTCTTTGCTTTTTTGATGGACTAAGCTATATTATCCGCCAAATTATATTGACTAAGCTTATTTTATCTGCCAAGAGTGGATTTGAAATTTTACTGAGCAGGATCAAACAGTTTTGAGAAGTTCTCTCTTATGGAGTATTTATGTAATTGTTATAGTGATCACTTTGACAATTCATTGTACAGTTGGAATAGAGTACTACGTCTTGGAAATTTAACATACATAGAAGCTAAAAAGAATACAAGTTACAAATCTACTAATTCAAAATGACTAGATAATCATTTAAAAAGTTTAGCACACTTTTCATCCTTGATATGTGAAGTAGGACTGCTAGTTCCAGTAAAACACTTATATTTGAATTGTGGTTTCTGTTGCCATAACCTTTACTTATGGTGCATGACTAAAGATAATTCAAAAATGCGTAACAATTTTTCAAGTTCTTATAACTCTTTCTTCATGAATCATTTGTACATACATGTCAATAAGGTTTTAGATAACTCTTCAGATTTGCACAAAATGGTGCAAAATTTGAAGCCACTTAGCATATTGTGATAAATCATTGCACATCTTAACAGGGGTAAAAGTCAAGTAAATAAAGGTTAAATGCCACTGTTTATTTAATCATGCCTGGGAAGGTCACTACCACTGTCTCCACTCAACATCAATTGATTTTTGCTTCCATTGCTGATACACAATTGCATGTGAAATTAGATAACTGTAGACGAGGTAAATGCTAAGGCCGTAGAAGTCATACATATGATACTTAAAGAAGGAAGAAGTAGGGAACAATTCATTTTGGAGAACTAGTATTTGATAAAGCAGTTGTCTGCCCCTTGTGCAGTTGCACTGGGCTTCATTCTTGTGGTGTAAAGTTTTGATAAAAAATGGATTTTTGTGTATTTTTCGTATAGACAATCGAAAACTTTTCATTGACAAAAAATTATTGTCCATTCCACTGCTGAAAGTAGCAGAAACATTACGGTTGGAAAAGAGCGCTGATGTTAATTGGGAATAAATCATTCCTATTAATTTACAGTTGGTAGTTCAAACAATTAAAGGTGAAAAGATCATATGCCACTATTACTTATTATGGTCACACTATTGTTTCTTCTTTGATCAGATTTCTCAAAATCATATTATTTTAATAAAACATAGATCATGTATCTCAGTGAATCTATATGAGTTTCCCCTTTTTGCTTTAGTCCTTTTCACTATTGGTTCGAACTAGTATAGCGCAGTGAGAGGAAGGCTCAATGGTGCAATGTTTGGCACTAACTATATCATAGTCCTTGACATTATCCACTTAACATGTCTAGCCTGAACATGCCAAGGAGATATGGCTTTTTATTCCATCCTTTGACTTGATTATTAATTCTTGACAGAGTAAGAACAAACTCATCATGTCTGGTCAATTTCCTATCAAAAGCTAAAAGCCTGCTCTATAAAACGGTAGGTCCTGAATCCACAACATTTGCAATGGTGAGTTAAACAAGTAAGAATCATCTTTTACTATGTATCCATCTGTGAGCTGTTTCTTTTGATAAGGTATTATCCAAGCAAGTACCCAGGAGGTACTGCAAAAAGGAAAAGGACAGAATTACACAAGTCTTGAGAAGACAACAATCATTCATCTCAAAGAGGTTACCAAATTTAGCACAACTAAAGTTCATCAATTTCCTTTCGTTAAAGCAGTAGATTATGCATTTGTACTTAACAGCTGCAATCTGCTTCCCCTCTCCATCAAAACATTTTCTGTTTCTTTCCAACCAGATACTCCGCACACTGTACAGAGGGGATGTCCTCCATATTTTCTCAGTCCAGATTTCTGCACTTGCCAGATTAATACAAAACTATTCAGATCTCGTGGCATGACCCAATGCACTACAAACACACATAACAAAACTGTCCAAATCTGCCAAGAAAATTTACAGGAATAAACAAATGGTTAGTTGATACCACTTCCCTTTGACGCAGCCAAGCATTTCTAGTTTCCACCCACCTAAAGAAAACAATTTTAGATGGTGCTTTTGTCTTCCAAATCATCCATCTCTGAACTGTTTATATGAGACAAACAAAAGCTAGTTTAAGTCTTGGTATCACATAATTTGAAGCATTGGGGGTTCTGGAATTTTACTTTAAGTTCAAGTGCTTGAGTGAGTGATGGACTACAGAGGTGATTTCGAGAGGGGAGAGAGATAACAAGGGGTAATGGGAGATGTGTGCTTGTGGCGGTGTGGATTTTGGGCAAACATTATTCTTGGAGCATGAAATATCATCATCACCTTCTTTTCTCTCTGAGATTAGATTTTGAGCTAATTTCCCTAGAGATATTCAAAATCTAGCTCTTACAGGAGCCTTTACCAACAGCAGTGAAACAAAATCAGAATTCACTAGTTTTCTTTATCCCCTCGTGCAGGATAGAATAGGAAGCATTTGCTTGTTACTGAGAAGATTGTGGAGTCTTATATCTCAAAAAGAAATGATTATGGAGTCTAATGATTAGGTCTACTTTGTCTACATACACTGTGTGCTCCTTGTTCCTTTTTACTCTAAGTTTTAATTAGTTGTTAATAATATTATATACCCTATCTAAAGAGCTAGTAAGACCTCCTAAATTTGCGTAATATCCTCACTTTGTTGAAGCTAACTCACGTATCCAAAATTCAAAAGAAAATCTTATTTTGTCGATTTTGACCTCTAGTTTCAGCCATTTAGGAGAAAGTAATACTGAAGTTCATTTTATGGATTTTAACCCCCAGTCTCAACTATTTAGGAGAAAATAACACTTAAGCATAAGAAAAGACATAATGGTGAAAATGGAGGCTACGGTCTGTCGATGCTTATGGGGTTTGAAGAAGAGGACCTCCATGGGATGATGAATCTATGGTCCTATTCCAGAGATGATACAGCCACCAAAAGAAAAGGCTTTGTAGAGCTTAAT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Download sequence region

Download sequence (6.8Kb)

Get flanking sequences on SL2.50ch04

mRNA Solyc04g076960.2.1

Ontology terms

terms associated with this mRNA

GO:0008506 – sucrose:hydrogen symporter activity

cDNA sequence

spliced cDNA sequence, including UTRs

>Solyc04g076960.2.1 Sucrose transporter (AHRD V1 **** Q9FVJ6_SOLLC); contains Interpro domain(s) IPR005989 Sucrose/H+ symporter, plant
AAAAAGTGTAAAGCAATTTTAGGCATATATACCAACCTACATATTCCCCCTCGTGCCTTTAGCTTAATTACAACTCTACCCCGAGAATAATCTATTTTTCTGCTCACTGTTCTCAATATATCTCGTAATTTCACCAATCTTCAAGGGCATTTTCAGCACGTCCTCCCTCTTCCACCACCTCGCCACCTTCTTCCTCCAAATTCTCCATTAACACACATCAATACGTTGACGTTTTGATATTTGAACGATGCCGGAGATAGAAAGGCATAGAACAAGGCATAACCGACCGGCGATTCGAGAACCGGTGAAACCGAGAGTACCACTGAGACTATTGTTACGAGTAGCTTCGGTTGCCGGTGGAATTCAATTCGGTTGGGCGTTACAACTATCGCTGCTCACACCTTATGTGCAGGAGCTTGGAATACCGCATGCTTGGGCGAGCATAATATGGCTCTGTGGACCGCTTTCAGGTTTATTGGTTCAGCCTTTAGTAGGTCACATGAGTGACAAGTGCACAAGTCGGTTCGGTCGTCGGCGTCCGTTTATTGTCGCCGGAGCAGCATCTATCATGATTGCGGTGTTGATTATCGGTTTCTCCGCTGATATTGGATGGCTTTTAGGTGATCGAGGTGAAATAAAAGTGCGTGCTATAGCGGCGTTTGTTGTAGGGTTTTGGCTTCTCGATGTTGCTAATAATATGACTCAAGGACCTTGCAGAGCTCTGCTTGCTGATCTTACACAAAAGGATCACAGAAGAACTCGGGTAGCAAATGCATATTTTTCCTTATTTATGGCCATTGGTAACATCCTTGGCTTTGCTACTGGATCTTACAGTGGCTGGTACAAGATCTTCCCTTTTACTCTCAATACTGCATGCACCATCAACTGTGCCAATCTAAAGGCTGCTTTTATTCTCGACATTATTTTTATTGCAACAACAACATGCATTAGCATATCGGCGGCCAATGAGCAGCCTCTAGATCCCAGTCGTGGTTCCTCTCATACTGGAGAAGAGATTGACGAATCAAGCCATGGTCAAGAAGAAGCTTTTCTCTGGGAGTTGTTTGGTATTTTCAAGTATTTCCCAGGTGTTGTTTGGGTGATCCTGCTTGTCACTGCCCTGACATGGATTGGATGGTTTCCATTTCTTTTGTTCGATACTGACTGGTTTGGTCGAGAAATTTATGGCGGTGAACCAAATGACGGAAAGAATTATAGTGCAGGAGTGCGGATGGGTTCATTGGGTCTAATGTTGAATTCTGTCCTTCTTGGACTAACTTCATTGTTCATGGAGAAGCTCTGTCGAAAATGGGGGGCTGGTTTCACATGGGGAGTTTCTAACGTGGTCATGTCTCTCTGCTTTATAGCCATGCTTATAATTACTGCTGTTAGGAGTAACATAGACATTGGCCAGGGTCTTCCGCCGGATGGAATTGTGATTGCTGCGCTGGTTGTATTTTCTATTCTTGGGATCCCACTAGCTATAACGTACAGTGTTCCATATGCTTTAGTATCCTCAAGGATTGAAGCTCTTGGGCTTGGACAAGGCTTGTCAATGGGCGTGCTGAACCTGGCAATTGTGTTCCCACAGATTGTGGTTTCACTGGGAAGTGGGCCATGGGATGAGCTATTTGGTGGAGGCAATTCACCAGCCTTTGTTGTGGCTGCGCTTTCAGCATTTGCTGGTGGACTTATAGCCATCTTGGCAATTCCTCGAACACGGGTTGAGAGACCCAAGATCTTTGCATGA

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Protein sequence

translated polypeptide sequence

Related features

Features that derive from this mRNA

Type	Name	Location	Length	Strand	Phase
polypeptide	Solyc04g076960.2.1	SL2.50ch04:61903880..61910593	501	-	n/a

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Type	Name	Location	Length	Strand	Phase
gene	Solyc04g076960.2	SL2.50ch04:61903881..61910840	6,960	-	n/a

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Features that are parts of this mRNA

Type	Name	Location	Length	Strand	Phase
exon	exon:Solyc04g076960.2.1.1	SL2.50ch04:61910101..61910840	740	-	n/a
exon	exon:Solyc04g076960.2.1.2	SL2.50ch04:61904975..61905717	743	-	2
exon	exon:Solyc04g076960.2.1.3	SL2.50ch04:61904539..61904602	64	-	n/a
exon	exon:Solyc04g076960.2.1.4	SL2.50ch04:61904412..61904455	44	-	2
exon	exon:Solyc04g076960.2.1.5	SL2.50ch04:61903881..61904039	159	-	n/a
intron	intron:Solyc04g076960.2.1.2	SL2.50ch04:61905718..61910100	n/a	-	n/a
intron	intron:Solyc04g076960.2.1.3	SL2.50ch04:61904603..61904974	n/a	-	n/a
intron	intron:Solyc04g076960.2.1.4	SL2.50ch04:61904456..61904538	n/a	-	n/a
intron	intron:Solyc04g076960.2.1.5	SL2.50ch04:61904040..61904411	n/a	-	n/a

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Genetic loci

Tomato locus sut4 (SlSUT4)

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Accessions	Seedlots
Accessions		Breeding Program	Seedlot Name	Contents	Seedlot Location	Count	Weight(g)

Attribute	Value
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