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Solanum lycopersicum gene Solyc04g055110.2
Gene
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| Features that are parts of this gene |
| Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
|---|---|---|---|---|---|
| mRNA | Solyc04g055110.2.1 | SL2.50ch04:53710473..53724633 | 2,193 | + | n/a |
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Genomic sequence
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| unprocessed genomic sequence region underlying this gene |
>Solyc04g055110.2 SL2.50ch04:53710473..53724633
CAGGTATAGTTGCCGACAAGAAGGTGGATTAAAAAGTAAATTCTGACTCTTTCGGTTAGATGAGCATGGATAAAGCTTCTGCTGACTGTCCATACCCAGGATGCTTCTTCTGTGTTATGAAAGAAGGAAACCCAAGCAAACGCCGAGCAAGTATATTGAAGTTTTTTCGAGAACTTCCTTCACAGGATGATGATGGTCAAGTTCTTCCCATCAGTGGCCTATGGAACACAGCCATGGCACATCCTAACGATCCGGAGTTTATTGAATTGGGGATTTTTGAATGCATGTCAGCACTTATTTGGAAGGGTTTAAAGAACCGCCGGTGGCTTTCACATGACCAAAATATATATATTCCTTATTATGCAGCACATATAATTGGATCATATACCATGAATATGGAAGAATTTGCTGATAGAGCTGTGCGTGCTGGAATCATCCCTCCTTTAGTTGAACTCTTGAGAGGTAGGCTAACTTGGGTTGAACAGAGAGTTGCAGTGAGAGCTTTAGGACACTTAGCTACCTATGCCAGCACCTTTCCAGCTGTTGCAAGTCACGGTGAGATTCTAGAGCTCTCCATCCAACTCGCTATGAGTTCTCTTGAAATTGTTTACTCTCACTTTTACCAATATGTTGATAGAAGACTTAGTTATCATTGCGACCTTCTTACGCGTGGTATGGGTGGAGTTGAAATGGAGTCCAGGAAGGCAGAAGAATGGGCCAGTCAGCTACAATGTTGGTCCCTTCAGCTTATTAATTGCTTTGCTTTCAAACCTGAATTTCTTCCTACTATTTGCAAGCCAGAATTTCTAGCAAAGCTTCCAGGAATGTGGGGTGGACTTGTTAATGAAAACTCCCCTGCTGGAATCGGTCTGTTAAGGACAATTTGCCATCACAAGCTTGGTAGAGGGCCTGTTGCTGCATGTCCTGGTATTATAGAGGCATTGTGCAATATAGCTCGCTCATCGGATGACTGGCAGTATATGGCAATTGACTGTCTTTTGTGGTTGCTCCAGGATCCAAGTACCTGTCATAAGGTAATTATATTCTCTAGAACTATTCTGCTGGAGCTAATAGCTGGAATATTTTATTCGGTATTGGTTTTACTTTCAATATAATCAGGTGGAAGAATAGAGCACTAATGGTAGAATATGACATATGTATGTTATATAAATAATTTTATTTCTCTCTTTTACTTCTTGGAGCTTAACTTTGACCATAAAAGACCATCCATTAAATGTAAAAGTGCTCCATCCTTTTCCAATGTTGCTTGTGTGCGTCCAGAACTTGTTTATACAAAATAGGTATGCTTCACTCCTTGGATACTCTTCTCTTGGTTCCCTATGAAGGTATCTTATCAAATATGTTTAAGTGATCTTTGAAGTCAATTTTGTTCATACTACCCAGCAGACTCTAATTTAAAGAGGTTGGTCCTTCAGAATGTGAATAAGAATTCATATTTGGGGCATGCATGTGTACCATAATGATAATCTGTAGAGAGACAAAGGAAACAAAAGATGAGTTTTCTAGTAATGTGGAACTCTGTGTGAACTTTAAAGCATGCATGCTATCGGTATAGCCCCATAGGCATAAGTGATCACCCCCAAAAGAAACTGTCTTAAAAGTAATGTTCCACTGTACTTGTCCATAAAAGAAAAATCAGATGTCGTCAGAACAGGTCTCAGAATACTGTACTATGTATTCTGCTACTTAGCCTGGGATATTCAGCTCCATTTGATGAAGTCTGTGTATACTAGAATAAGAATTGAAGACAAACATGCAACACTTGAGAGATGTATTATTAATAAGATGGTATTAGTAAGTATTAGAAAGAAATAGAAATGAAGAAAAGAATCAATCCGCAAATAGGAGAACCTGCTTCATCAATGAAATAGGAGAACCTGAGTTCTGAAGTTTGATATATACCCTCTCAATCTGGTGCCGACTCCATGGTGAAGCATGTAAGGCACTTGCTTTAGGCCCCTGGGTGGGGGTGGGGGGAGTTGAAAGGTAAAAAAATTTCATAGAAAAAGAATGATAATTTTGTTACATATGTGAATAATTCATCGAATAATTATTATGGGATGTGCTAAAACTTAATTTGAGTTCATCAGATGACGAGAAGTTAAAAAGGTATTAACCTAATGACTGTTCCTTGCAAGTCAATCTGATATTTGATGCTTATACTTATTTTCTAAGTTAAAATGTTAAAGAAAATAGTACAAGTAGAAAATATTAATCTTAACAGACATATTCAAGCAATTGAATAGATTTGATTCTTTTTCAAATTCTTTTCTTCTAAAATAATGTTAATTATTCATGTAACAGTTGATAGTTGCCTCAAAACGGTAAAAAGTTCTTTTGAAGTTACAATTGAAAATTTTTACTTGAGATCAACAATTTCAAAAGAGATTAAATGAGTTGATTTTAGGGAAAAGGGTCAAAATTTACCTTTCTACTTTATTTTACTTGTCTTTGCCCCTATCGTTAAGAACAAGTTATTTTTACCCCTGCCGTTAATAAACTTAACAAATATACCCTTCCTTGGATGGAAAACCCCAAATTAATTAAAATTATCCGAGTTAACTAAAATTGCCCAATTCTAACCCAACCCGACCCACTTAATAATATACATTTTTTCTTTTACCCAAATCAATTTAATTTTCACCCACCCCCCACCACCAAAGCCTCATCTACATACTTAGAGATGTCTTCAGCCACGAATAACGTTGCCATTGAACACCTTTGATATTATGTTAAAAACTGGACAAGCAATTGAACCATTGGCACAACTAATGGAGACAACTTATATATGGGATGAATGGGTTAGTTATTGTCTGATATTCCATTTAGTTTATGACTCTGCTTGCATTATACTGCTAGTACCAATGGAATCAATGAATTAGTGGATTCAATTTTTAACAAATATATCAATTTTTAACATAATATCAAAGGTGTTCAATATCCCTCTCCTGAGTGTCGCGACGTCATTCGTAGCTGAAGACATCTCTAAGTATGCTGATGAGGCTTTGGTGGTGGTGGTGGTGAAAATAAAGTTGATTTGGAAAAAAAATGGATTGTATTATTAAGTGGGTCGGGTCGGGTTAAAATTGGGTAATTTAAGTAAAATTGGATAATTTTAATTGATTTAGGGTTTTCCATCCAAGGAGGGGTATATTTGTTAAGTTTATTGACGGCAGTGGTAAAAATAACTTGTTTTTAACGGCAGGGGTAAAATCAACCAATAAAACAAAGTGTTGAGTGGTAATTTTGACCCTTTTCCCTTGATTTTATTATTATTCGAAAAAGAATTATTAGAAGAACTATATAATAACAAAATATTAATGGCTTTTCATCTCAAAAAGCTAGAAGAATAGATTTTTGTGGGAAAAAAAGATATTCTATTTTGTAAATTTAAGGCCTCCAAATAAATTTTGGCTTTAGGCCGCTAGAGTGCTTGAGCCACCACTGTCTCAATCACATAATAATTGAAAAGCTTCTTCAACCACCACCAGTACCAGTGTCTTCATTTGCATATGGATAACATCATGTATTCGACGGAATGACTTAAAGCAAAGAGGGTGGTGTGAGGGTGTTGGTCATGTTTACTTATGCGGGTCTCTGTTTTCACCTGATTTCACTATTGTTACTATCTATGATGCCTGTCTGTCTTGAAGGTGTTTGGCTTTGTGCTGTCAAAAAGGTTAAAATGAGCATCTTGTTTGGTTGGTCCACTACTTCTTTAAGATATTCTGTTTAACAAGTATTACAGTCCTGAGTTAAGTTCTGCTGTTAACAAAGATCACTCTTTCTTATTGTTGGTAAGATGCACCAAATCAGTAGAGTCATACAATTAGGACTGATCGAATTCTTGATGAACCATTAAGTAGGTTTTGTTTTGTCCTATCTATTTTCAGGTAGAACCAGAGAACCTGTTTTAGAGGTGGAAAGTGACACAATGTGATGAAATCATATTAGTTTATCCTTCTGGAGTAACTCACCTTAGACCTTTTGCAACAGATAGAAAAATCTACTTGCACAATGAGAATAACTGCAAGTGCTATTAGCTAGAAGGGTAATTAATTCTCATTCTGCTTTAATAGTAATCTTCTCATTGTACTTTATGGAAGTCTCTCATCTTCCAGGTTAAAAGAGAAGTGAATATCATAGCTATTTTGCGGAGAAGAGAATACAACTACTACTACTATGTCTCAGTCCCTAACAAGTTAGAGTTGGCTATAGAAATTCTTGTTGTCCATGTTTATCCATTTTAAAGTCATCTACGTGAATATTACAAAAATTAGTACTTGAAACACTATATTTTATACTGGCATAAAATTTTCTGATAGGGCTAAAAGACTAGAAAGCACAAGACCTAAAGTAAACTTGCTAACATGCCTGTAATATTCTTCCAACTTGTTAGTATCATCTATATTAATCTTTTCTTCCCTTGTGCCTTGTCTCTCATGAAGTTTGCATGGATTCCAAAGAGATTGTAGGTACTTTTAGACAAGTTCTTTCCATGTGATTTTAGGTCTATCGTTTCCCTTTTAACGCCTTGATTCACCATGGTTTTACACCTACAGACCGGTGCATTGGAGATTGACGCAAGACATGATTAAACCATCCTAAGCGATCTTCACTCTATCCTCAAAATATGCTTGCACCTTCTGAGGAATGTGGTCATTTTTCATCTTGTCTAGTCTTGTATGACTGCAAAATCATCGTACCTGCATCTCTGTGACACATCTTTTGGATGTATTGGATTTTGTGGTCCAACATTCACTTTCACTTAATATTGTTGGTTTTATGACTTGTTCTATAGAACTTATCGTTGATGGGCATCCTTCTATTACGTAACACCATGGTAGCACTTCCACATTGCAACCATCCGACTCTGGTTCTATGTATATCTGCATCTATCCTTGGTTTTCTTAGAATAATGAACCTAGACTCTGAATTGTTTGCATTGAGGCACCACAATCACGTCTAATTTCACTTCA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Ontology terms
| terms associated with this mRNA |
cDNA sequence
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>Solyc04g055110.2.1 Mitochondrial import receptor subunit TOM34 (AHRD V1 *--- TOM34_RAT); contains Interpro domain(s) IPR011990 Tetratricopeptide-like helical
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Protein sequence
Protein sequence
| translated polypeptide sequence |
>Solyc04g055110.2.1 Mitochondrial import receptor subunit TOM34 (AHRD V1 *--- TOM34_RAT); contains Interpro domain(s) IPR011990 Tetratricopeptide-like helical
MDKASADCPYPGCFFCVMKEGNPSKRRASILKFFRELPSQDDDGQVLPISGLWNTAMAHPNDPEFIELGIFECMSALIWKGLKNRRWLSHDQNIYIPYYAAHIIGSYTMNMEEFADRAVRAGIIPPLVELLRGRLTWVEQRVAVRALGHLATYASTFPAVASHGEILELSIQLAMSSLEIVYSHFYQYVDRRLSYHCDLLTRGMGGVEMESRKAEEWASQLQCWSLQLINCFAFKPEFLPTICKPEFLAKLPGMWGGLVNENSPAGIGLLRTICHHKLGRGPVAACPGIIEALCNIARSSDDWQYMAIDCLLWLLQDPSTCHKVIEKAVPALVDLAGISSLGDHKKLGDSIVNVLQECIESQGTGRTQINSHVKEEVEELLNSKQRLKWEKNMPKEDLHIKQAAALVVKLEGNSLFSSGNISGAAAKYSEALALCPMRSKKERVVLYSNRAQCHLLLQQPLAAIGDATRALCLHNPVNRHAKSLWRRAQAYDMLGLAKESLLDAILFINECSQSNDPDLSLRQNKVPDYAERLVKKQMRAAWLFREAAIKHGGVQCEGDAGDMCGQETDDSEWETASESEIGNEERDEIGDDICGWENEVERKDKYKKASLKEVKHGYNVQLTEDNV*
MDKASADCPYPGCFFCVMKEGNPSKRRASILKFFRELPSQDDDGQVLPISGLWNTAMAHPNDPEFIELGIFECMSALIWKGLKNRRWLSHDQNIYIPYYAAHIIGSYTMNMEEFADRAVRAGIIPPLVELLRGRLTWVEQRVAVRALGHLATYASTFPAVASHGEILELSIQLAMSSLEIVYSHFYQYVDRRLSYHCDLLTRGMGGVEMESRKAEEWASQLQCWSLQLINCFAFKPEFLPTICKPEFLAKLPGMWGGLVNENSPAGIGLLRTICHHKLGRGPVAACPGIIEALCNIARSSDDWQYMAIDCLLWLLQDPSTCHKVIEKAVPALVDLAGISSLGDHKKLGDSIVNVLQECIESQGTGRTQINSHVKEEVEELLNSKQRLKWEKNMPKEDLHIKQAAALVVKLEGNSLFSSGNISGAAAKYSEALALCPMRSKKERVVLYSNRAQCHLLLQQPLAAIGDATRALCLHNPVNRHAKSLWRRAQAYDMLGLAKESLLDAILFINECSQSNDPDLSLRQNKVPDYAERLVKKQMRAAWLFREAAIKHGGVQCEGDAGDMCGQETDDSEWETASESEIGNEERDEIGDDICGWENEVERKDKYKKASLKEVKHGYNVQLTEDNV*
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| Features that derive from this mRNA |
| Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
|---|---|---|---|---|---|
| polypeptide | Solyc04g055110.2.1 | SL2.50ch04:53710537..53724389 | 628 | + | n/a |
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| Features this mRNA is a part of |
| Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
|---|---|---|---|---|---|
| gene | Solyc04g055110.2 | SL2.50ch04:53710473..53724633 | 14,161 | + | n/a |
Add items to a list:
| Features that are parts of this mRNA |
| Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
|---|---|---|---|---|---|
| exon | exon:Solyc04g055110.2.1.1 | SL2.50ch04:53710473..53711506 | 1,034 | + | n/a |
| exon | exon:Solyc04g055110.2.1.2 | SL2.50ch04:53716752..53717619 | 868 | + | n/a |
| exon | exon:Solyc04g055110.2.1.3 | SL2.50ch04:53724343..53724633 | 291 | + | n/a |
| intron | intron:Solyc04g055110.2.1.1 | SL2.50ch04:53711507..53716751 | n/a | + | n/a |
| intron | intron:Solyc04g055110.2.1.2 | SL2.50ch04:53717620..53724342 | n/a | + | n/a |
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