This site uses cookies to provide logins and other features. Please accept the use of cookies by clicking Accept.
Solanum lycopersicum gene Solyc04g014210.2
Gene
Gene
|
Genome Viewer
Genome Viewer
|
Related features
Related features
|
| Features that are parts of this gene |
| Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
|---|---|---|---|---|---|
| mRNA | Solyc04g014210.2.1 | SL2.50ch04:4509385..4517601 | 5,418 | + | n/a |
Add items to a list:
Genomic sequence
Genomic sequence
| unprocessed genomic sequence region underlying this gene |
>Solyc04g014210.2 SL2.50ch04:4509385..4517601
ATGCATGATTCTTCCTCCTACAATCGCCGGTTCCCGGCTCCGGCGATGTATCACCAGCACTGTTATCGATCGTCAAGTAACAGGCCATGTCGTCCGGGTTTTTATTCTTCGAGTTACGAGCTTGATCGACCGCCGGGACATTCGCACAAGTCGCCGAATTTCGTAATCCAGCTGCGTTATGGTAACCGGAGAATCAACCGGTACGGATTAGATGATCTAATTGAGAAATTACCGTTTGCCCCTCGTAGTTCGTTTGTTTTTAGCAAAGGGTTCCTTTCTGGGTCACTGTTGTATGATCAATGGAGCGAAACGCTTGAAGTGATTGTGAAATTATGGAGAATGAGGCTTTCAGGTAGTCATTCGTTTACTCCATGGGTTAAACGAAACGTTGAGGTTCCATCTGATGAGGATGAATTGAAAGGTAGGGTAAAAATGGTATTTTTGGAGGAGTTGAAAGGGTTGTTAGTGGAGGGTGAACTGTTACAAAAGTGGGAGAAGAAGTTGGAATTGTTGCGCGATGAAATTTGTGAATTGTCGAGATTACTGAAGAACAGGAATAATTTGAGGGTGTGTAATGAGTTTCTGAAGAAAAGGGAAGGTCTTGAGAAGGAGAGTGATTTGATAAGGAAGAGGATAGAGGAGTTTAAAAGAGGAATTGAATGTATTATTCAACAGTTGGAGGAGACGAGTTTAGAGGAGGGTGGTTCAAGGGTGTTTAAGATTGGGACAGAGTTTGATTGGAGTAAAATTCATTGTTTGATGATGAGGGAGTGTCGCAGGCTTGATGATGGCTTGCCAATTTTCGCTTTCCGGCAGCAGATACTTAGGCAAATACATTATCAACAGGTGCTCAATCTATTTGTGTTTTTAATCTCATTAGAGTTTAGACAATCAGGTCACTTGTTGGTGATTACATGTAAATCTCCTTATAAGCATTAGTTGGTAACCAAGTAAAAAGTGATAACTAACTTGCAGTTTAAAATCATTGTGTAAAAAGAATCTTTACATTGTTTGTGTACGTAGCTCCATTATTACCCTGTTGAATATGTATAAAACTTAAAATCTTCTCGTTATCACTGTGTTGAATAGTAGGAGCAGGAATACTTGCACCGTAGTTCATTAGCCAAAATAATTAGTGCATGACAAGTGTTTTGTGCATGAGTTTTATCAGTTAACCATGGTTGGTTTATATGCGTGCTTACCTCACTTTTATCCTTAAACTGTTCCATAACTATGGTAAATTAACATAGAGCCTGTTTGGATTGGCTTATTTTAGGTGCTTTTAAGCAGTTTTGTAGTGTTCAGTTGAAATATAAAAGTGTAAGCAAAAATAAAAATAATAAGTCGAAAGTCAGAAGTTAGAAATCCTAACTTATGGTTTGTCATTAAAAAAAAAGGAAATCCTAACTTATGGTTTTAACTTATAAACCATTAGTTATAAGCCCATCCAAACAGGCTCATAGTTGGTGCAGGCACCAGGTCGGACTTTTGTTTTTTCCGGGTATGGGGAGAACAGACATGTATGCAAACCAACCAAACGTTCCCCTCCCTTCCCCGACCCCTTGCATTTACGAGAATACACAAACTTGTGACATAGAGGATGCCTTAGAGCAACTATACCTTGTGTGAGGGCATGTCCTCTCCATTACTCTGCAAAGTAAAAGCCTGAGGATTCATAGATGCAGAATGTCCCATTCTTGTTGGTTTCTCTCCAGTAATTGATTTTTGTGAAGAGGCCGGTACTATATGAGAAGAATTTCTACCATCATGGTGGATATTTCAACTTTCTGCACATGAAATGATGAAAAGGTTAGCAGTGAGAAGGGGTAGCACTAAGCCCCTAACCGAAGCAGCAGCCTTTTATTTTACTTAAAAGTTATTGTTTTCAGTGGTAACAGATATCGGCATTGGTAGCCCTATACAACCGCCAACCAGTAAGTTCATACTAGGTACCATAATGGCTTTATTATTAGTATACGCTTTTGTAGCTCCAATTCAGACAATTTTTTGTGCGAACAACTGAGCCCAGCAAATCCAAGGAATTCTGTTCTCAATAACATTAGATCTTTCATCATCATTATAACAGTTTTTCTTTCCACTGTTTCCACCGGAAGAAAAATGTGGAAGGCAACATCGTTCCCAGAGTAAGAAGCCAGCCGAATTGCCAATTCATTTAGATTTTTTATTCTAAAAACATATACTAAATTTAAAATATACTAGCAAGGCTAAATTAGTCAAATTTAATTTCTTAATATTTATAATAATATAGTAGAGGAATCGTTACAATAAAAATCTAAATAAATTAGCTAAGTGTAATATTGTAAACCATGAGGGAGGTCAGTGTTATAAAGAGAAACCTGAGGGGAGGTCTCTAATAGTACCTTTTCATTTCGGTCTAAAATAAGTAATGTTTCACATTATCAAGAAGGTATGGATTTTTTCCTTTCAAATCTACCCCTGTTTAGATAAGTGAATTGTTTTCTTTCGAATTTACCCCTGTTTAGATAAGTGAATTTTTATGTTACCTAGGAACTGTCTTAAATAGGTACTATTTAATTAAGGGTAAGTTAGTAAAAGCGATTTTTACTTTTTAGGAGTGTGTAAATTTCTTAAGGGGTGTGTCCAAGCTAAAAGCGCCACTTAATATGGACCGGAGGGAGTAATAATTATCTTTAACTTTTTTCTGGTGATTTTTTTGATAGGAAATTTTGAGCTGAAATGAAGATATTGTTGATTTTGTAGTATTTTGGTTGGAACATTAGGTGAAGTAGTTACATTACTCAGTAAGAAAATTTATGAAATTGTGTTGAATCGTTGTTATTTGCTGTTTGCAGGTTCTGTAGAAGTATTTATTTTTCTTTATTCCCCTCTTCATTCTTGTTTCCAGTCTAACACTTAATTTCACAAATGCCTTATTTATATCGACTTTGTGAAGAGGGATATTTTAGACTGTTGAATGCCTATTTCCGAAGGTCTTTCAATCGCTCCTAGCATACTTGTGTAATATTAATTATTTACCAGTCATTTATGTTAAATTGTTTGAGCTTCTTTCTTTATTTTTCTTTTGTATTTACTATTATAATTTAGACGGTTGTATCTATTAGGTGACTGTCTTAATTGGTGAGACTGGATCAGGAAAAAGTACGCAATTGGTTCAATTCCTAGCTGATTGTGGGGTAACTGGTAATGGGTCTATAGTTTGCACTCAGCCTCGGAAACTTGCTGCGAATTCTTTGGCACAAAGGGTGAAACAGGAAAGTGAAGGGTGTTACGAAGATAACTCGATCATCTGCTATCCGTCATATTCATCTGGTCATAAGTTTGATTCAAAAGTAGTATTTATGACGGATCATTGCCTTCTACAGCACTATATGGTCGATAAGAGTTTGTCCAAGATTTCATGTATCATAGTTGATGAGGCACATGAAAGAAGCCTAGACACTGATCTACTTTTAGCATTGATAAAGAATCTTCTCCTTCAGAGGCTTGATCTGAGGCTTGTTATTATGTCTGCCACAGCTGATGCAGCTCAGCTTGCGGATTACTTCTTTGGCTGCGGAACATTCCATGTGGCTGGTAGAACTTTTCCGGTTGATATTGAATATGTTCCCTGTGAATCCAGTGGATGTCTTGGTGTTGGCCCTATCTCCTCCTATGTGTATGATGTTGTCAAGATGGTGACCGAAATCCATGAAACTGAGGGAGAGGGAACAATTCTGGCTTTCTTGACTTCTCAGATTGAAGTTGAGTGGGCTTGTGTGAAGTTTCAAACATTGTCAGCTATTTCTTTACCTTTACATGGCAAACTATCCCATGAAGAGCAGCATAGAGTTTTTCTCAGCTATCCGGGAAAGAGAAAGGTAATATTCACCACAAATGTTGCTGAGACATCATTGACAATTCCAGGGGTTAAATATGTTGTTGATTCTGGCATGGTCAAAGAAAGCAGGTTTGAGCCTGGCACTTGCATGAGTATTCTCAGGATATGCAATGTCAGCCAGAGCTCAGCTAAGCAGCGGGCTGGTCGTGCTGGGAGAACTGGACCAGGAAGATGTTATCGACTGTACTCGGAAAGTGATTTTGAAGGTATGTCTCATCATCAGGAACCTGAAATTCGCAAGGTTCATCTTGGTGTTGCAGTGCTGAGGATTCTTGCCTTGGGCATTAAGAATGTGCATGATTTTGATTTTGTTGACGCACCTAGCCCTAAAGCTATTGAGATGGCCACCAGAAATCTGGTACAGTTAGGAGCTGTTGGGAAAAAAGATTCTGCTTATGAATTAACTATAGAAGGGCACAAAATAATTAAGTTGGGTATTGAACCTCGGTTAGGCAAATTGATCCTCAGTTGTTTTAATCAACGTTTGAGTAGAGAAGGTGTTGTTCTTGCTGCTGTTATGGCTAATTCCAGCAGCATCTTTTGTAGGGTTGGTTCTGAAGGAGACAAGCTAAAATCCGATTGCTTGAAGGTGCAATTTTGCCATCCAAATGGTGATCTCTTCACTTTACTTTCTGTTTACAAGGAATGGGAGGCTGTGCCTAAGGAAGGAAAGAATTCCTGGTGTTGGGATAATAGCATCAATGCCAAATCCATGAGAAGATGCCAGGAGACTGTGCAAGAACTGGAAGCATGCCTTAAGAGCGAACTTAATATCATTGTTGCAAGCTACTGGCATTGGGATCCTCAGATGCATACCGAGCATGATGAAACTTTGAAAAGAATAATACTTTCTTCATTTGCAGAGAATGTTGCTATGTATTCTGGATATGATCAACTAGGTTATGAGGTTGCACTCAGTAAAAAGTACATCCAACTACATCCGTCCTGTTCGTTGTTAAATTTTGATCGACGACCAACCTGGGTAGTGTTCGGTGAAATCCTTTCTGCAGCTAATGAGTATTTGGTCTGTGTTACTGCATTTGAGTTTAGTTCTCTTTCTGCTCTTAGTCCTTCCCCGTTGTTTAATTTTCTGGAGATGGATGCCCAAAAGCTGGAAAAGAAAGTTTTGACAGGTTTTGGGAGCATGCTATTGAAAAGATTCTGTGGAAAATCTAACAGTAGTGTCAATAACCTTGTTTCACGCATTAGAACTAAGTATATGGATGAAAGGATTGGCATTCAAGTTAATGTTGGTAAGAATGAGGTTCTGTTATATGCTTCATCCAGTGATATGGAGAGTGTTTTAGGTCAAGTGAATGGTGCACTAGAATATGAAAGCAAGTTGTTGCAGAATGAATGCTTGGAAAAAGGCCTATTTAGTGGTGGATCGGCTGCATCGGCCTCAGTTGCGCTCCTTGGAGCTGGTGCAATTGTTAAACATTTGGAGCTTAAGAAGAGAATCTTGGCTGTTGACATATTTCATTCAAATACAAAAGCAGTTGATGATAAGGAACTGCTGATGTTTTTGGAGAGAAACACATCTAGTGATATTTGTGCAGTGCACAAGTCCTCAGGTACTGGCCACGACAATGAGGAGAACAGATGGGGCAGGGTAACATTTCTTTCCCCTGATGCTGCTAAACAAGCTATGTTGTTGAATCAGGTAGAATGTAATGGTGGCTTTCTAAAAGTTGTTCCTTCGAGGAGTGTATTTAGTAATGATCAAAAGCAATTCTCCTCTGTCCTCAGAACTAGAGTAAATTGGCCTCGTAGATGCTGTAATGGTGTAGCTATTGTAAAATGTGAGCCAAATGATGTTGGCTTTATGGTAAAAGATTTCTCTGTCGTAATGATAGGTGGAAACACCATCCGTTCAAAGCCAAGCAATAAGTACTCTGACAGCATAGTAATATCAGGACTTAATACGGATCATTCTGAGACAGAGGTACTCGAGATTTTGAGTGGAGCTACAGATGGGAAAATTCTGGATTTTTTCTTTGTGAGAGGAAGTGCTGTGGAAAATCCTCCAGTTGCAGCTTGTGAAGAAGCACTTAGGAGAGAAATCTCCCCCTTCATGCCTAAAAAAGCACCTTTTGTCCAGTCTATTCGTGTTCAGGTCTTCCAACCAGAACCAAAGGATACTTACATGCGAGCGTCTATCATGTTTGATGGAAGTCTTCATCTTGAAGCAGCTAAGGCTTTGGAGCATATTGATGGCAAGGTTTTATCTGGATGTCTTCCCTGGCAGAAGATAAGATGTCAGCAACAGTTCCACAGCTCTGTTTCCTGTCCTGCACCTGTTTACCATGTTATTAGGAACCAGCTGGATTCTCTACTCCCATGCCTCCAGCGAAGAAATGGTATCTTAACTTCTCCATGTTATATTTCTTTTTTGTGTTTTTTTTTTTTTGAAAATTTTAATTTGATTAATGATCATCTTTGCTGAATTGCTTCTTTAAAAAGGCATGGCGAAATGGGAAATAAACTATTGAGCAGTGGCTTATATGGTATTTAATTTAGGTGACAGAGTTAGTGTACCTCATTACTTCCATTGATCTAAATTGCTGCTGTCACTTTTTTGTTTCCTTATTTCCTAGAGCAGAATGAAATTATCTCCCAGATTTAATGTTGATCTGATGATTACTTGCCTTGTACGGAGAAATAACCTTTTGTCCGGTCAAATTCAAAACGGTAATTGGGAAAAAACATTCTTGCATTCTACGGATTACCCTCTCTACATTTCTGTCCTGTTACATTCTGGTGTTGCAGAAATATATGGGATATAATAAGACAAGGTTTAGTAAAACAATTTTTTAATTAACTTTTAACAGTAAAAAATTTCGGAGACAAGTTGATCAGGTGGTACTTGACTGCTGAGAAGACTTTGGGATTGTTTTGCAGGTGTGGAGTGCAATCTGGAGAGAAATGAGAATGGTTCTTTTAGGGTTAAAATATCTGCAAGTGCTACAAAGATTGTGGCAGAACTGAGAAGGCCATTGGAGCAACTGATGAAAGGCAAGATTGTGGATCATGTGGGAATTTCTCCAACTGTTGTTCAACTTCTATTTTCTAGGGAAGGGAATAATATCATGAAGATGGTTCAGCAAGAAACAGGAACCTATATTCTTTTTGACAGGCATAGCCTTTCTGTGAGAATCTTTGGTTCCTCCGACAAGATTGATATGGCTGAGCGGAAGTTTGTTAACTCCCTTCTGGCACTACATGAAAGCAAGCAACTTGAAGTGCATCTTCGTGGAGGACTTTTGCCTCTTGACCTGATGAAAAGAGTTGTTCAGAGTTTTGGACCAGATCTTAGTGGTCTCAAACTAAAGGTGCCCGATGCAGAATTCTCTCTGAACACAAAGCGTCATTGCATCTCTGTCAAAGGTACCAAAGACATGAAGCAAAAAGTTGAGGAGATAATTTCCGAAATTGCTCACAGTGGTCTTCCAAGTATAATGATGGACAATGAGACGGACTGCCCCATTTGCTTGTGTGAACTGGAGGATGCTTACAGACTTGAAGGTTGTACCCACACCTTCTGTCGGTCGTGCTTGCTGGAGCAGTGCGAGTCTGCAATCAGAAGCCGGGAAGGTTTCCCTCTATGCTGTATGCATAAAGGTTGTGGGGCACATATTCTGGTTTCTGATTTGAGGTCTCTGTTGTCGAATGATAAGTTGGAGGAACTTTTCAGGGCTTCTTTAGGGGCATTTGTAGCAGCAAGTGGGGGTCTCTACCGGTTTTGCCCCTCCCCTGACTGCCCTTCAGTTTATCATGTTACTGAATCAGGAGAAGCTGGTGCACCTTTTATCTGTGGCGCATGCTATGTGGAGACGTGTACGAGTTGCCACCTGGAGTATCACCCCTACATCTCATGCGAGAAGTACAAGGAGTTCAAGGACAACCCGGATTTCTCTCTAGAGGAATGGGCCAAGGGGAAAGAGAATGTGAAGAAATGTCCTGTTTGCGGGTTCACGATAGAGAAGATAGATGGCTGCAATCATATCGAGTGCAAGTGTGGAAAACATGTTTGCTGGGTTTGTTTGGTATTCTTCAGCAGCAGCGACGATTGCTATAACCATCTGAGGTCTCTTCACCAGGCCATTATGTGAGGTGCAAAAAACTAAAACTCTGTAAATATTCTGCTTGTGTATATATTTCTGGAACTTTGAATTACATCTAAACAAATGAATGTAGTAGTATATACAATAGTAAAACCATCTAAATATTACCCCTTTAAGTATGATGTTTATATAGACACTTGTGTAATTATGTGTTCACAACTTTTAACTCTTTTAGAACCATCTAAATATTACCCCTTTAAGTATGTTTATATA
ATGCATGATTCTTCCTCCTACAATCGCCGGTTCCCGGCTCCGGCGATGTATCACCAGCACTGTTATCGATCGTCAAGTAACAGGCCATGTCGTCCGGGTTTTTATTCTTCGAGTTACGAGCTTGATCGACCGCCGGGACATTCGCACAAGTCGCCGAATTTCGTAATCCAGCTGCGTTATGGTAACCGGAGAATCAACCGGTACGGATTAGATGATCTAATTGAGAAATTACCGTTTGCCCCTCGTAGTTCGTTTGTTTTTAGCAAAGGGTTCCTTTCTGGGTCACTGTTGTATGATCAATGGAGCGAAACGCTTGAAGTGATTGTGAAATTATGGAGAATGAGGCTTTCAGGTAGTCATTCGTTTACTCCATGGGTTAAACGAAACGTTGAGGTTCCATCTGATGAGGATGAATTGAAAGGTAGGGTAAAAATGGTATTTTTGGAGGAGTTGAAAGGGTTGTTAGTGGAGGGTGAACTGTTACAAAAGTGGGAGAAGAAGTTGGAATTGTTGCGCGATGAAATTTGTGAATTGTCGAGATTACTGAAGAACAGGAATAATTTGAGGGTGTGTAATGAGTTTCTGAAGAAAAGGGAAGGTCTTGAGAAGGAGAGTGATTTGATAAGGAAGAGGATAGAGGAGTTTAAAAGAGGAATTGAATGTATTATTCAACAGTTGGAGGAGACGAGTTTAGAGGAGGGTGGTTCAAGGGTGTTTAAGATTGGGACAGAGTTTGATTGGAGTAAAATTCATTGTTTGATGATGAGGGAGTGTCGCAGGCTTGATGATGGCTTGCCAATTTTCGCTTTCCGGCAGCAGATACTTAGGCAAATACATTATCAACAGGTGCTCAATCTATTTGTGTTTTTAATCTCATTAGAGTTTAGACAATCAGGTCACTTGTTGGTGATTACATGTAAATCTCCTTATAAGCATTAGTTGGTAACCAAGTAAAAAGTGATAACTAACTTGCAGTTTAAAATCATTGTGTAAAAAGAATCTTTACATTGTTTGTGTACGTAGCTCCATTATTACCCTGTTGAATATGTATAAAACTTAAAATCTTCTCGTTATCACTGTGTTGAATAGTAGGAGCAGGAATACTTGCACCGTAGTTCATTAGCCAAAATAATTAGTGCATGACAAGTGTTTTGTGCATGAGTTTTATCAGTTAACCATGGTTGGTTTATATGCGTGCTTACCTCACTTTTATCCTTAAACTGTTCCATAACTATGGTAAATTAACATAGAGCCTGTTTGGATTGGCTTATTTTAGGTGCTTTTAAGCAGTTTTGTAGTGTTCAGTTGAAATATAAAAGTGTAAGCAAAAATAAAAATAATAAGTCGAAAGTCAGAAGTTAGAAATCCTAACTTATGGTTTGTCATTAAAAAAAAAGGAAATCCTAACTTATGGTTTTAACTTATAAACCATTAGTTATAAGCCCATCCAAACAGGCTCATAGTTGGTGCAGGCACCAGGTCGGACTTTTGTTTTTTCCGGGTATGGGGAGAACAGACATGTATGCAAACCAACCAAACGTTCCCCTCCCTTCCCCGACCCCTTGCATTTACGAGAATACACAAACTTGTGACATAGAGGATGCCTTAGAGCAACTATACCTTGTGTGAGGGCATGTCCTCTCCATTACTCTGCAAAGTAAAAGCCTGAGGATTCATAGATGCAGAATGTCCCATTCTTGTTGGTTTCTCTCCAGTAATTGATTTTTGTGAAGAGGCCGGTACTATATGAGAAGAATTTCTACCATCATGGTGGATATTTCAACTTTCTGCACATGAAATGATGAAAAGGTTAGCAGTGAGAAGGGGTAGCACTAAGCCCCTAACCGAAGCAGCAGCCTTTTATTTTACTTAAAAGTTATTGTTTTCAGTGGTAACAGATATCGGCATTGGTAGCCCTATACAACCGCCAACCAGTAAGTTCATACTAGGTACCATAATGGCTTTATTATTAGTATACGCTTTTGTAGCTCCAATTCAGACAATTTTTTGTGCGAACAACTGAGCCCAGCAAATCCAAGGAATTCTGTTCTCAATAACATTAGATCTTTCATCATCATTATAACAGTTTTTCTTTCCACTGTTTCCACCGGAAGAAAAATGTGGAAGGCAACATCGTTCCCAGAGTAAGAAGCCAGCCGAATTGCCAATTCATTTAGATTTTTTATTCTAAAAACATATACTAAATTTAAAATATACTAGCAAGGCTAAATTAGTCAAATTTAATTTCTTAATATTTATAATAATATAGTAGAGGAATCGTTACAATAAAAATCTAAATAAATTAGCTAAGTGTAATATTGTAAACCATGAGGGAGGTCAGTGTTATAAAGAGAAACCTGAGGGGAGGTCTCTAATAGTACCTTTTCATTTCGGTCTAAAATAAGTAATGTTTCACATTATCAAGAAGGTATGGATTTTTTCCTTTCAAATCTACCCCTGTTTAGATAAGTGAATTGTTTTCTTTCGAATTTACCCCTGTTTAGATAAGTGAATTTTTATGTTACCTAGGAACTGTCTTAAATAGGTACTATTTAATTAAGGGTAAGTTAGTAAAAGCGATTTTTACTTTTTAGGAGTGTGTAAATTTCTTAAGGGGTGTGTCCAAGCTAAAAGCGCCACTTAATATGGACCGGAGGGAGTAATAATTATCTTTAACTTTTTTCTGGTGATTTTTTTGATAGGAAATTTTGAGCTGAAATGAAGATATTGTTGATTTTGTAGTATTTTGGTTGGAACATTAGGTGAAGTAGTTACATTACTCAGTAAGAAAATTTATGAAATTGTGTTGAATCGTTGTTATTTGCTGTTTGCAGGTTCTGTAGAAGTATTTATTTTTCTTTATTCCCCTCTTCATTCTTGTTTCCAGTCTAACACTTAATTTCACAAATGCCTTATTTATATCGACTTTGTGAAGAGGGATATTTTAGACTGTTGAATGCCTATTTCCGAAGGTCTTTCAATCGCTCCTAGCATACTTGTGTAATATTAATTATTTACCAGTCATTTATGTTAAATTGTTTGAGCTTCTTTCTTTATTTTTCTTTTGTATTTACTATTATAATTTAGACGGTTGTATCTATTAGGTGACTGTCTTAATTGGTGAGACTGGATCAGGAAAAAGTACGCAATTGGTTCAATTCCTAGCTGATTGTGGGGTAACTGGTAATGGGTCTATAGTTTGCACTCAGCCTCGGAAACTTGCTGCGAATTCTTTGGCACAAAGGGTGAAACAGGAAAGTGAAGGGTGTTACGAAGATAACTCGATCATCTGCTATCCGTCATATTCATCTGGTCATAAGTTTGATTCAAAAGTAGTATTTATGACGGATCATTGCCTTCTACAGCACTATATGGTCGATAAGAGTTTGTCCAAGATTTCATGTATCATAGTTGATGAGGCACATGAAAGAAGCCTAGACACTGATCTACTTTTAGCATTGATAAAGAATCTTCTCCTTCAGAGGCTTGATCTGAGGCTTGTTATTATGTCTGCCACAGCTGATGCAGCTCAGCTTGCGGATTACTTCTTTGGCTGCGGAACATTCCATGTGGCTGGTAGAACTTTTCCGGTTGATATTGAATATGTTCCCTGTGAATCCAGTGGATGTCTTGGTGTTGGCCCTATCTCCTCCTATGTGTATGATGTTGTCAAGATGGTGACCGAAATCCATGAAACTGAGGGAGAGGGAACAATTCTGGCTTTCTTGACTTCTCAGATTGAAGTTGAGTGGGCTTGTGTGAAGTTTCAAACATTGTCAGCTATTTCTTTACCTTTACATGGCAAACTATCCCATGAAGAGCAGCATAGAGTTTTTCTCAGCTATCCGGGAAAGAGAAAGGTAATATTCACCACAAATGTTGCTGAGACATCATTGACAATTCCAGGGGTTAAATATGTTGTTGATTCTGGCATGGTCAAAGAAAGCAGGTTTGAGCCTGGCACTTGCATGAGTATTCTCAGGATATGCAATGTCAGCCAGAGCTCAGCTAAGCAGCGGGCTGGTCGTGCTGGGAGAACTGGACCAGGAAGATGTTATCGACTGTACTCGGAAAGTGATTTTGAAGGTATGTCTCATCATCAGGAACCTGAAATTCGCAAGGTTCATCTTGGTGTTGCAGTGCTGAGGATTCTTGCCTTGGGCATTAAGAATGTGCATGATTTTGATTTTGTTGACGCACCTAGCCCTAAAGCTATTGAGATGGCCACCAGAAATCTGGTACAGTTAGGAGCTGTTGGGAAAAAAGATTCTGCTTATGAATTAACTATAGAAGGGCACAAAATAATTAAGTTGGGTATTGAACCTCGGTTAGGCAAATTGATCCTCAGTTGTTTTAATCAACGTTTGAGTAGAGAAGGTGTTGTTCTTGCTGCTGTTATGGCTAATTCCAGCAGCATCTTTTGTAGGGTTGGTTCTGAAGGAGACAAGCTAAAATCCGATTGCTTGAAGGTGCAATTTTGCCATCCAAATGGTGATCTCTTCACTTTACTTTCTGTTTACAAGGAATGGGAGGCTGTGCCTAAGGAAGGAAAGAATTCCTGGTGTTGGGATAATAGCATCAATGCCAAATCCATGAGAAGATGCCAGGAGACTGTGCAAGAACTGGAAGCATGCCTTAAGAGCGAACTTAATATCATTGTTGCAAGCTACTGGCATTGGGATCCTCAGATGCATACCGAGCATGATGAAACTTTGAAAAGAATAATACTTTCTTCATTTGCAGAGAATGTTGCTATGTATTCTGGATATGATCAACTAGGTTATGAGGTTGCACTCAGTAAAAAGTACATCCAACTACATCCGTCCTGTTCGTTGTTAAATTTTGATCGACGACCAACCTGGGTAGTGTTCGGTGAAATCCTTTCTGCAGCTAATGAGTATTTGGTCTGTGTTACTGCATTTGAGTTTAGTTCTCTTTCTGCTCTTAGTCCTTCCCCGTTGTTTAATTTTCTGGAGATGGATGCCCAAAAGCTGGAAAAGAAAGTTTTGACAGGTTTTGGGAGCATGCTATTGAAAAGATTCTGTGGAAAATCTAACAGTAGTGTCAATAACCTTGTTTCACGCATTAGAACTAAGTATATGGATGAAAGGATTGGCATTCAAGTTAATGTTGGTAAGAATGAGGTTCTGTTATATGCTTCATCCAGTGATATGGAGAGTGTTTTAGGTCAAGTGAATGGTGCACTAGAATATGAAAGCAAGTTGTTGCAGAATGAATGCTTGGAAAAAGGCCTATTTAGTGGTGGATCGGCTGCATCGGCCTCAGTTGCGCTCCTTGGAGCTGGTGCAATTGTTAAACATTTGGAGCTTAAGAAGAGAATCTTGGCTGTTGACATATTTCATTCAAATACAAAAGCAGTTGATGATAAGGAACTGCTGATGTTTTTGGAGAGAAACACATCTAGTGATATTTGTGCAGTGCACAAGTCCTCAGGTACTGGCCACGACAATGAGGAGAACAGATGGGGCAGGGTAACATTTCTTTCCCCTGATGCTGCTAAACAAGCTATGTTGTTGAATCAGGTAGAATGTAATGGTGGCTTTCTAAAAGTTGTTCCTTCGAGGAGTGTATTTAGTAATGATCAAAAGCAATTCTCCTCTGTCCTCAGAACTAGAGTAAATTGGCCTCGTAGATGCTGTAATGGTGTAGCTATTGTAAAATGTGAGCCAAATGATGTTGGCTTTATGGTAAAAGATTTCTCTGTCGTAATGATAGGTGGAAACACCATCCGTTCAAAGCCAAGCAATAAGTACTCTGACAGCATAGTAATATCAGGACTTAATACGGATCATTCTGAGACAGAGGTACTCGAGATTTTGAGTGGAGCTACAGATGGGAAAATTCTGGATTTTTTCTTTGTGAGAGGAAGTGCTGTGGAAAATCCTCCAGTTGCAGCTTGTGAAGAAGCACTTAGGAGAGAAATCTCCCCCTTCATGCCTAAAAAAGCACCTTTTGTCCAGTCTATTCGTGTTCAGGTCTTCCAACCAGAACCAAAGGATACTTACATGCGAGCGTCTATCATGTTTGATGGAAGTCTTCATCTTGAAGCAGCTAAGGCTTTGGAGCATATTGATGGCAAGGTTTTATCTGGATGTCTTCCCTGGCAGAAGATAAGATGTCAGCAACAGTTCCACAGCTCTGTTTCCTGTCCTGCACCTGTTTACCATGTTATTAGGAACCAGCTGGATTCTCTACTCCCATGCCTCCAGCGAAGAAATGGTATCTTAACTTCTCCATGTTATATTTCTTTTTTGTGTTTTTTTTTTTTTGAAAATTTTAATTTGATTAATGATCATCTTTGCTGAATTGCTTCTTTAAAAAGGCATGGCGAAATGGGAAATAAACTATTGAGCAGTGGCTTATATGGTATTTAATTTAGGTGACAGAGTTAGTGTACCTCATTACTTCCATTGATCTAAATTGCTGCTGTCACTTTTTTGTTTCCTTATTTCCTAGAGCAGAATGAAATTATCTCCCAGATTTAATGTTGATCTGATGATTACTTGCCTTGTACGGAGAAATAACCTTTTGTCCGGTCAAATTCAAAACGGTAATTGGGAAAAAACATTCTTGCATTCTACGGATTACCCTCTCTACATTTCTGTCCTGTTACATTCTGGTGTTGCAGAAATATATGGGATATAATAAGACAAGGTTTAGTAAAACAATTTTTTAATTAACTTTTAACAGTAAAAAATTTCGGAGACAAGTTGATCAGGTGGTACTTGACTGCTGAGAAGACTTTGGGATTGTTTTGCAGGTGTGGAGTGCAATCTGGAGAGAAATGAGAATGGTTCTTTTAGGGTTAAAATATCTGCAAGTGCTACAAAGATTGTGGCAGAACTGAGAAGGCCATTGGAGCAACTGATGAAAGGCAAGATTGTGGATCATGTGGGAATTTCTCCAACTGTTGTTCAACTTCTATTTTCTAGGGAAGGGAATAATATCATGAAGATGGTTCAGCAAGAAACAGGAACCTATATTCTTTTTGACAGGCATAGCCTTTCTGTGAGAATCTTTGGTTCCTCCGACAAGATTGATATGGCTGAGCGGAAGTTTGTTAACTCCCTTCTGGCACTACATGAAAGCAAGCAACTTGAAGTGCATCTTCGTGGAGGACTTTTGCCTCTTGACCTGATGAAAAGAGTTGTTCAGAGTTTTGGACCAGATCTTAGTGGTCTCAAACTAAAGGTGCCCGATGCAGAATTCTCTCTGAACACAAAGCGTCATTGCATCTCTGTCAAAGGTACCAAAGACATGAAGCAAAAAGTTGAGGAGATAATTTCCGAAATTGCTCACAGTGGTCTTCCAAGTATAATGATGGACAATGAGACGGACTGCCCCATTTGCTTGTGTGAACTGGAGGATGCTTACAGACTTGAAGGTTGTACCCACACCTTCTGTCGGTCGTGCTTGCTGGAGCAGTGCGAGTCTGCAATCAGAAGCCGGGAAGGTTTCCCTCTATGCTGTATGCATAAAGGTTGTGGGGCACATATTCTGGTTTCTGATTTGAGGTCTCTGTTGTCGAATGATAAGTTGGAGGAACTTTTCAGGGCTTCTTTAGGGGCATTTGTAGCAGCAAGTGGGGGTCTCTACCGGTTTTGCCCCTCCCCTGACTGCCCTTCAGTTTATCATGTTACTGAATCAGGAGAAGCTGGTGCACCTTTTATCTGTGGCGCATGCTATGTGGAGACGTGTACGAGTTGCCACCTGGAGTATCACCCCTACATCTCATGCGAGAAGTACAAGGAGTTCAAGGACAACCCGGATTTCTCTCTAGAGGAATGGGCCAAGGGGAAAGAGAATGTGAAGAAATGTCCTGTTTGCGGGTTCACGATAGAGAAGATAGATGGCTGCAATCATATCGAGTGCAAGTGTGGAAAACATGTTTGCTGGGTTTGTTTGGTATTCTTCAGCAGCAGCGACGATTGCTATAACCATCTGAGGTCTCTTCACCAGGCCATTATGTGAGGTGCAAAAAACTAAAACTCTGTAAATATTCTGCTTGTGTATATATTTCTGGAACTTTGAATTACATCTAAACAAATGAATGTAGTAGTATATACAATAGTAAAACCATCTAAATATTACCCCTTTAAGTATGATGTTTATATAGACACTTGTGTAATTATGTGTTCACAACTTTTAACTCTTTTAGAACCATCTAAATATTACCCCTTTAAGTATGTTTATATA
| Download sequence region |
Get flanking sequences on SL2.50ch04
|
mRNA Solyc04g014210.2.1
mRNA Solyc04g014210.2.1
|
Ontology terms
Ontology terms
| terms associated with this mRNA |
cDNA sequence
cDNA sequence
| spliced cDNA sequence, including UTRs |
>Solyc04g014210.2.1 ATP dependent RNA helicase (AHRD V1 *-*- B8BR58_THAPS); contains Interpro domain(s) IPR014001 DEAD-like helicase, N-terminal
ATGCATGATTCTTCCTCCTACAATCGCCGGTTCCCGGCTCCGGCGATGTATCACCAGCACTGTTATCGATCGTCAAGTAACAGGCCATGTCGTCCGGGTTTTTATTCTTCGAGTTACGAGCTTGATCGACCGCCGGGACATTCGCACAAGTCGCCGAATTTCGTAATCCAGCTGCGTTATGGTAACCGGAGAATCAACCGGTACGGATTAGATGATCTAATTGAGAAATTACCGTTTGCCCCTCGTAGTTCGTTTGTTTTTAGCAAAGGGTTCCTTTCTGGGTCACTGTTGTATGATCAATGGAGCGAAACGCTTGAAGTGATTGTGAAATTATGGAGAATGAGGCTTTCAGGTAGTCATTCGTTTACTCCATGGGTTAAACGAAACGTTGAGGTTCCATCTGATGAGGATGAATTGAAAGGTAGGGTAAAAATGGTATTTTTGGAGGAGTTGAAAGGGTTGTTAGTGGAGGGTGAACTGTTACAAAAGTGGGAGAAGAAGTTGGAATTGTTGCGCGATGAAATTTGTGAATTGTCGAGATTACTGAAGAACAGGAATAATTTGAGGGTGTGTAATGAGTTTCTGAAGAAAAGGGAAGGTCTTGAGAAGGAGAGTGATTTGATAAGGAAGAGGATAGAGGAGTTTAAAAGAGGAATTGAATGTATTATTCAACAGTTGGAGGAGACGAGTTTAGAGGAGGGTGGTTCAAGGGTGTTTAAGATTGGGACAGAGTTTGATTGGAGTAAAATTCATTGTTTGATGATGAGGGAGTGTCGCAGGCTTGATGATGGCTTGCCAATTTTCGCTTTCCGGCAGCAGATACTTAGGCAAATACATTATCAACAGGTGACTGTCTTAATTGGTGAGACTGGATCAGGAAAAAGTACGCAATTGGTTCAATTCCTAGCTGATTGTGGGGTAACTGGTAATGGGTCTATAGTTTGCACTCAGCCTCGGAAACTTGCTGCGAATTCTTTGGCACAAAGGGTGAAACAGGAAAGTGAAGGGTGTTACGAAGATAACTCGATCATCTGCTATCCGTCATATTCATCTGGTCATAAGTTTGATTCAAAAGTAGTATTTATGACGGATCATTGCCTTCTACAGCACTATATGGTCGATAAGAGTTTGTCCAAGATTTCATGTATCATAGTTGATGAGGCACATGAAAGAAGCCTAGACACTGATCTACTTTTAGCATTGATAAAGAATCTTCTCCTTCAGAGGCTTGATCTGAGGCTTGTTATTATGTCTGCCACAGCTGATGCAGCTCAGCTTGCGGATTACTTCTTTGGCTGCGGAACATTCCATGTGGCTGGTAGAACTTTTCCGGTTGATATTGAATATGTTCCCTGTGAATCCAGTGGATGTCTTGGTGTTGGCCCTATCTCCTCCTATGTGTATGATGTTGTCAAGATGGTGACCGAAATCCATGAAACTGAGGGAGAGGGAACAATTCTGGCTTTCTTGACTTCTCAGATTGAAGTTGAGTGGGCTTGTGTGAAGTTTCAAACATTGTCAGCTATTTCTTTACCTTTACATGGCAAACTATCCCATGAAGAGCAGCATAGAGTTTTTCTCAGCTATCCGGGAAAGAGAAAGGTAATATTCACCACAAATGTTGCTGAGACATCATTGACAATTCCAGGGGTTAAATATGTTGTTGATTCTGGCATGGTCAAAGAAAGCAGGTTTGAGCCTGGCACTTGCATGAGTATTCTCAGGATATGCAATGTCAGCCAGAGCTCAGCTAAGCAGCGGGCTGGTCGTGCTGGGAGAACTGGACCAGGAAGATGTTATCGACTGTACTCGGAAAGTGATTTTGAAGGTATGTCTCATCATCAGGAACCTGAAATTCGCAAGGTTCATCTTGGTGTTGCAGTGCTGAGGATTCTTGCCTTGGGCATTAAGAATGTGCATGATTTTGATTTTGTTGACGCACCTAGCCCTAAAGCTATTGAGATGGCCACCAGAAATCTGGTACAGTTAGGAGCTGTTGGGAAAAAAGATTCTGCTTATGAATTAACTATAGAAGGGCACAAAATAATTAAGTTGGGTATTGAACCTCGGTTAGGCAAATTGATCCTCAGTTGTTTTAATCAACGTTTGAGTAGAGAAGGTGTTGTTCTTGCTGCTGTTATGGCTAATTCCAGCAGCATCTTTTGTAGGGTTGGTTCTGAAGGAGACAAGCTAAAATCCGATTGCTTGAAGGTGCAATTTTGCCATCCAAATGGTGATCTCTTCACTTTACTTTCTGTTTACAAGGAATGGGAGGCTGTGCCTAAGGAAGGAAAGAATTCCTGGTGTTGGGATAATAGCATCAATGCCAAATCCATGAGAAGATGCCAGGAGACTGTGCAAGAACTGGAAGCATGCCTTAAGAGCGAACTTAATATCATTGTTGCAAGCTACTGGCATTGGGATCCTCAGATGCATACCGAGCATGATGAAACTTTGAAAAGAATAATACTTTCTTCATTTGCAGAGAATGTTGCTATGTATTCTGGATATGATCAACTAGGTTATGAGGTTGCACTCAGTAAAAAGTACATCCAACTACATCCGTCCTGTTCGTTGTTAAATTTTGATCGACGACCAACCTGGGTAGTGTTCGGTGAAATCCTTTCTGCAGCTAATGAGTATTTGGTCTGTGTTACTGCATTTGAGTTTAGTTCTCTTTCTGCTCTTAGTCCTTCCCCGTTGTTTAATTTTCTGGAGATGGATGCCCAAAAGCTGGAAAAGAAAGTTTTGACAGGTTTTGGGAGCATGCTATTGAAAAGATTCTGTGGAAAATCTAACAGTAGTGTCAATAACCTTGTTTCACGCATTAGAACTAAGTATATGGATGAAAGGATTGGCATTCAAGTTAATGTTGGTAAGAATGAGGTTCTGTTATATGCTTCATCCAGTGATATGGAGAGTGTTTTAGGTCAAGTGAATGGTGCACTAGAATATGAAAGCAAGTTGTTGCAGAATGAATGCTTGGAAAAAGGCCTATTTAGTGGTGGATCGGCTGCATCGGCCTCAGTTGCGCTCCTTGGAGCTGGTGCAATTGTTAAACATTTGGAGCTTAAGAAGAGAATCTTGGCTGTTGACATATTTCATTCAAATACAAAAGCAGTTGATGATAAGGAACTGCTGATGTTTTTGGAGAGAAACACATCTAGTGATATTTGTGCAGTGCACAAGTCCTCAGGTACTGGCCACGACAATGAGGAGAACAGATGGGGCAGGGTAACATTTCTTTCCCCTGATGCTGCTAAACAAGCTATGTTGTTGAATCAGGTAGAATGTAATGGTGGCTTTCTAAAAGTTGTTCCTTCGAGGAGTGTATTTAGTAATGATCAAAAGCAATTCTCCTCTGTCCTCAGAACTAGAGTAAATTGGCCTCGTAGATGCTGTAATGGTGTAGCTATTGTAAAATGTGAGCCAAATGATGTTGGCTTTATGGTAAAAGATTTCTCTGTCGTAATGATAGGTGGAAACACCATCCGTTCAAAGCCAAGCAATAAGTACTCTGACAGCATAGTAATATCAGGACTTAATACGGATCATTCTGAGACAGAGGTACTCGAGATTTTGAGTGGAGCTACAGATGGGAAAATTCTGGATTTTTTCTTTGTGAGAGGAAGTGCTGTGGAAAATCCTCCAGTTGCAGCTTGTGAAGAAGCACTTAGGAGAGAAATCTCCCCCTTCATGCCTAAAAAAGCACCTTTTGTCCAGTCTATTCGTGTTCAGGTCTTCCAACCAGAACCAAAGGATACTTACATGCGAGCGTCTATCATGTTTGATGGAAGTCTTCATCTTGAAGCAGCTAAGGCTTTGGAGCATATTGATGGCAAGGTTTTATCTGGATGTCTTCCCTGGCAGAAGATAAGATGTCAGCAACAGTTCCACAGCTCTGTTTCCTGTCCTGCACCTGTTTACCATGTTATTAGGAACCAGCTGGATTCTCTACTCCCATGCCTCCAGCGAAGAAATGGTGTGGAGTGCAATCTGGAGAGAAATGAGAATGGTTCTTTTAGGGTTAAAATATCTGCAAGTGCTACAAAGATTGTGGCAGAACTGAGAAGGCCATTGGAGCAACTGATGAAAGGCAAGATTGTGGATCATGTGGGAATTTCTCCAACTGTTGTTCAACTTCTATTTTCTAGGGAAGGGAATAATATCATGAAGATGGTTCAGCAAGAAACAGGAACCTATATTCTTTTTGACAGGCATAGCCTTTCTGTGAGAATCTTTGGTTCCTCCGACAAGATTGATATGGCTGAGCGGAAGTTTGTTAACTCCCTTCTGGCACTACATGAAAGCAAGCAACTTGAAGTGCATCTTCGTGGAGGACTTTTGCCTCTTGACCTGATGAAAAGAGTTGTTCAGAGTTTTGGACCAGATCTTAGTGGTCTCAAACTAAAGGTGCCCGATGCAGAATTCTCTCTGAACACAAAGCGTCATTGCATCTCTGTCAAAGGTACCAAAGACATGAAGCAAAAAGTTGAGGAGATAATTTCCGAAATTGCTCACAGTGGTCTTCCAAGTATAATGATGGACAATGAGACGGACTGCCCCATTTGCTTGTGTGAACTGGAGGATGCTTACAGACTTGAAGGTTGTACCCACACCTTCTGTCGGTCGTGCTTGCTGGAGCAGTGCGAGTCTGCAATCAGAAGCCGGGAAGGTTTCCCTCTATGCTGTATGCATAAAGGTTGTGGGGCACATATTCTGGTTTCTGATTTGAGGTCTCTGTTGTCGAATGATAAGTTGGAGGAACTTTTCAGGGCTTCTTTAGGGGCATTTGTAGCAGCAAGTGGGGGTCTCTACCGGTTTTGCCCCTCCCCTGACTGCCCTTCAGTTTATCATGTTACTGAATCAGGAGAAGCTGGTGCACCTTTTATCTGTGGCGCATGCTATGTGGAGACGTGTACGAGTTGCCACCTGGAGTATCACCCCTACATCTCATGCGAGAAGTACAAGGAGTTCAAGGACAACCCGGATTTCTCTCTAGAGGAATGGGCCAAGGGGAAAGAGAATGTGAAGAAATGTCCTGTTTGCGGGTTCACGATAGAGAAGATAGATGGCTGCAATCATATCGAGTGCAAGTGTGGAAAACATGTTTGCTGGGTTTGTTTGGTATTCTTCAGCAGCAGCGACGATTGCTATAACCATCTGAGGTCTCTTCACCAGGCCATTATGTGAGGTGCAAAAAACTAAAACTCTGTAAATATTCTGCTTGTGTATATATTTCTGGAACTTTGAATTACATCTAAACAAATGAATGTAGTAGTATATACAATAGTAAAACCATCTAAATATTACCCCTTTAAGTATGATGTTTATATAGACACTTGTGTAATTATGTGTTCACAACTTTTAACTCTTTTAGAACCATCTAAATATTACCCCTTTAAGTATGTTTATATA
ATGCATGATTCTTCCTCCTACAATCGCCGGTTCCCGGCTCCGGCGATGTATCACCAGCACTGTTATCGATCGTCAAGTAACAGGCCATGTCGTCCGGGTTTTTATTCTTCGAGTTACGAGCTTGATCGACCGCCGGGACATTCGCACAAGTCGCCGAATTTCGTAATCCAGCTGCGTTATGGTAACCGGAGAATCAACCGGTACGGATTAGATGATCTAATTGAGAAATTACCGTTTGCCCCTCGTAGTTCGTTTGTTTTTAGCAAAGGGTTCCTTTCTGGGTCACTGTTGTATGATCAATGGAGCGAAACGCTTGAAGTGATTGTGAAATTATGGAGAATGAGGCTTTCAGGTAGTCATTCGTTTACTCCATGGGTTAAACGAAACGTTGAGGTTCCATCTGATGAGGATGAATTGAAAGGTAGGGTAAAAATGGTATTTTTGGAGGAGTTGAAAGGGTTGTTAGTGGAGGGTGAACTGTTACAAAAGTGGGAGAAGAAGTTGGAATTGTTGCGCGATGAAATTTGTGAATTGTCGAGATTACTGAAGAACAGGAATAATTTGAGGGTGTGTAATGAGTTTCTGAAGAAAAGGGAAGGTCTTGAGAAGGAGAGTGATTTGATAAGGAAGAGGATAGAGGAGTTTAAAAGAGGAATTGAATGTATTATTCAACAGTTGGAGGAGACGAGTTTAGAGGAGGGTGGTTCAAGGGTGTTTAAGATTGGGACAGAGTTTGATTGGAGTAAAATTCATTGTTTGATGATGAGGGAGTGTCGCAGGCTTGATGATGGCTTGCCAATTTTCGCTTTCCGGCAGCAGATACTTAGGCAAATACATTATCAACAGGTGACTGTCTTAATTGGTGAGACTGGATCAGGAAAAAGTACGCAATTGGTTCAATTCCTAGCTGATTGTGGGGTAACTGGTAATGGGTCTATAGTTTGCACTCAGCCTCGGAAACTTGCTGCGAATTCTTTGGCACAAAGGGTGAAACAGGAAAGTGAAGGGTGTTACGAAGATAACTCGATCATCTGCTATCCGTCATATTCATCTGGTCATAAGTTTGATTCAAAAGTAGTATTTATGACGGATCATTGCCTTCTACAGCACTATATGGTCGATAAGAGTTTGTCCAAGATTTCATGTATCATAGTTGATGAGGCACATGAAAGAAGCCTAGACACTGATCTACTTTTAGCATTGATAAAGAATCTTCTCCTTCAGAGGCTTGATCTGAGGCTTGTTATTATGTCTGCCACAGCTGATGCAGCTCAGCTTGCGGATTACTTCTTTGGCTGCGGAACATTCCATGTGGCTGGTAGAACTTTTCCGGTTGATATTGAATATGTTCCCTGTGAATCCAGTGGATGTCTTGGTGTTGGCCCTATCTCCTCCTATGTGTATGATGTTGTCAAGATGGTGACCGAAATCCATGAAACTGAGGGAGAGGGAACAATTCTGGCTTTCTTGACTTCTCAGATTGAAGTTGAGTGGGCTTGTGTGAAGTTTCAAACATTGTCAGCTATTTCTTTACCTTTACATGGCAAACTATCCCATGAAGAGCAGCATAGAGTTTTTCTCAGCTATCCGGGAAAGAGAAAGGTAATATTCACCACAAATGTTGCTGAGACATCATTGACAATTCCAGGGGTTAAATATGTTGTTGATTCTGGCATGGTCAAAGAAAGCAGGTTTGAGCCTGGCACTTGCATGAGTATTCTCAGGATATGCAATGTCAGCCAGAGCTCAGCTAAGCAGCGGGCTGGTCGTGCTGGGAGAACTGGACCAGGAAGATGTTATCGACTGTACTCGGAAAGTGATTTTGAAGGTATGTCTCATCATCAGGAACCTGAAATTCGCAAGGTTCATCTTGGTGTTGCAGTGCTGAGGATTCTTGCCTTGGGCATTAAGAATGTGCATGATTTTGATTTTGTTGACGCACCTAGCCCTAAAGCTATTGAGATGGCCACCAGAAATCTGGTACAGTTAGGAGCTGTTGGGAAAAAAGATTCTGCTTATGAATTAACTATAGAAGGGCACAAAATAATTAAGTTGGGTATTGAACCTCGGTTAGGCAAATTGATCCTCAGTTGTTTTAATCAACGTTTGAGTAGAGAAGGTGTTGTTCTTGCTGCTGTTATGGCTAATTCCAGCAGCATCTTTTGTAGGGTTGGTTCTGAAGGAGACAAGCTAAAATCCGATTGCTTGAAGGTGCAATTTTGCCATCCAAATGGTGATCTCTTCACTTTACTTTCTGTTTACAAGGAATGGGAGGCTGTGCCTAAGGAAGGAAAGAATTCCTGGTGTTGGGATAATAGCATCAATGCCAAATCCATGAGAAGATGCCAGGAGACTGTGCAAGAACTGGAAGCATGCCTTAAGAGCGAACTTAATATCATTGTTGCAAGCTACTGGCATTGGGATCCTCAGATGCATACCGAGCATGATGAAACTTTGAAAAGAATAATACTTTCTTCATTTGCAGAGAATGTTGCTATGTATTCTGGATATGATCAACTAGGTTATGAGGTTGCACTCAGTAAAAAGTACATCCAACTACATCCGTCCTGTTCGTTGTTAAATTTTGATCGACGACCAACCTGGGTAGTGTTCGGTGAAATCCTTTCTGCAGCTAATGAGTATTTGGTCTGTGTTACTGCATTTGAGTTTAGTTCTCTTTCTGCTCTTAGTCCTTCCCCGTTGTTTAATTTTCTGGAGATGGATGCCCAAAAGCTGGAAAAGAAAGTTTTGACAGGTTTTGGGAGCATGCTATTGAAAAGATTCTGTGGAAAATCTAACAGTAGTGTCAATAACCTTGTTTCACGCATTAGAACTAAGTATATGGATGAAAGGATTGGCATTCAAGTTAATGTTGGTAAGAATGAGGTTCTGTTATATGCTTCATCCAGTGATATGGAGAGTGTTTTAGGTCAAGTGAATGGTGCACTAGAATATGAAAGCAAGTTGTTGCAGAATGAATGCTTGGAAAAAGGCCTATTTAGTGGTGGATCGGCTGCATCGGCCTCAGTTGCGCTCCTTGGAGCTGGTGCAATTGTTAAACATTTGGAGCTTAAGAAGAGAATCTTGGCTGTTGACATATTTCATTCAAATACAAAAGCAGTTGATGATAAGGAACTGCTGATGTTTTTGGAGAGAAACACATCTAGTGATATTTGTGCAGTGCACAAGTCCTCAGGTACTGGCCACGACAATGAGGAGAACAGATGGGGCAGGGTAACATTTCTTTCCCCTGATGCTGCTAAACAAGCTATGTTGTTGAATCAGGTAGAATGTAATGGTGGCTTTCTAAAAGTTGTTCCTTCGAGGAGTGTATTTAGTAATGATCAAAAGCAATTCTCCTCTGTCCTCAGAACTAGAGTAAATTGGCCTCGTAGATGCTGTAATGGTGTAGCTATTGTAAAATGTGAGCCAAATGATGTTGGCTTTATGGTAAAAGATTTCTCTGTCGTAATGATAGGTGGAAACACCATCCGTTCAAAGCCAAGCAATAAGTACTCTGACAGCATAGTAATATCAGGACTTAATACGGATCATTCTGAGACAGAGGTACTCGAGATTTTGAGTGGAGCTACAGATGGGAAAATTCTGGATTTTTTCTTTGTGAGAGGAAGTGCTGTGGAAAATCCTCCAGTTGCAGCTTGTGAAGAAGCACTTAGGAGAGAAATCTCCCCCTTCATGCCTAAAAAAGCACCTTTTGTCCAGTCTATTCGTGTTCAGGTCTTCCAACCAGAACCAAAGGATACTTACATGCGAGCGTCTATCATGTTTGATGGAAGTCTTCATCTTGAAGCAGCTAAGGCTTTGGAGCATATTGATGGCAAGGTTTTATCTGGATGTCTTCCCTGGCAGAAGATAAGATGTCAGCAACAGTTCCACAGCTCTGTTTCCTGTCCTGCACCTGTTTACCATGTTATTAGGAACCAGCTGGATTCTCTACTCCCATGCCTCCAGCGAAGAAATGGTGTGGAGTGCAATCTGGAGAGAAATGAGAATGGTTCTTTTAGGGTTAAAATATCTGCAAGTGCTACAAAGATTGTGGCAGAACTGAGAAGGCCATTGGAGCAACTGATGAAAGGCAAGATTGTGGATCATGTGGGAATTTCTCCAACTGTTGTTCAACTTCTATTTTCTAGGGAAGGGAATAATATCATGAAGATGGTTCAGCAAGAAACAGGAACCTATATTCTTTTTGACAGGCATAGCCTTTCTGTGAGAATCTTTGGTTCCTCCGACAAGATTGATATGGCTGAGCGGAAGTTTGTTAACTCCCTTCTGGCACTACATGAAAGCAAGCAACTTGAAGTGCATCTTCGTGGAGGACTTTTGCCTCTTGACCTGATGAAAAGAGTTGTTCAGAGTTTTGGACCAGATCTTAGTGGTCTCAAACTAAAGGTGCCCGATGCAGAATTCTCTCTGAACACAAAGCGTCATTGCATCTCTGTCAAAGGTACCAAAGACATGAAGCAAAAAGTTGAGGAGATAATTTCCGAAATTGCTCACAGTGGTCTTCCAAGTATAATGATGGACAATGAGACGGACTGCCCCATTTGCTTGTGTGAACTGGAGGATGCTTACAGACTTGAAGGTTGTACCCACACCTTCTGTCGGTCGTGCTTGCTGGAGCAGTGCGAGTCTGCAATCAGAAGCCGGGAAGGTTTCCCTCTATGCTGTATGCATAAAGGTTGTGGGGCACATATTCTGGTTTCTGATTTGAGGTCTCTGTTGTCGAATGATAAGTTGGAGGAACTTTTCAGGGCTTCTTTAGGGGCATTTGTAGCAGCAAGTGGGGGTCTCTACCGGTTTTGCCCCTCCCCTGACTGCCCTTCAGTTTATCATGTTACTGAATCAGGAGAAGCTGGTGCACCTTTTATCTGTGGCGCATGCTATGTGGAGACGTGTACGAGTTGCCACCTGGAGTATCACCCCTACATCTCATGCGAGAAGTACAAGGAGTTCAAGGACAACCCGGATTTCTCTCTAGAGGAATGGGCCAAGGGGAAAGAGAATGTGAAGAAATGTCCTGTTTGCGGGTTCACGATAGAGAAGATAGATGGCTGCAATCATATCGAGTGCAAGTGTGGAAAACATGTTTGCTGGGTTTGTTTGGTATTCTTCAGCAGCAGCGACGATTGCTATAACCATCTGAGGTCTCTTCACCAGGCCATTATGTGAGGTGCAAAAAACTAAAACTCTGTAAATATTCTGCTTGTGTATATATTTCTGGAACTTTGAATTACATCTAAACAAATGAATGTAGTAGTATATACAATAGTAAAACCATCTAAATATTACCCCTTTAAGTATGATGTTTATATAGACACTTGTGTAATTATGTGTTCACAACTTTTAACTCTTTTAGAACCATCTAAATATTACCCCTTTAAGTATGTTTATATA
Protein sequence
Protein sequence
| translated polypeptide sequence |
>Solyc04g014210.2.1 ATP dependent RNA helicase (AHRD V1 *-*- B8BR58_THAPS); contains Interpro domain(s) IPR014001 DEAD-like helicase, N-terminal
MHDSSSYNRRFPAPAMYHQHCYRSSSNRPCRPGFYSSSYELDRPPGHSHKSPNFVIQLRYGNRRINRYGLDDLIEKLPFAPRSSFVFSKGFLSGSLLYDQWSETLEVIVKLWRMRLSGSHSFTPWVKRNVEVPSDEDELKGRVKMVFLEELKGLLVEGELLQKWEKKLELLRDEICELSRLLKNRNNLRVCNEFLKKREGLEKESDLIRKRIEEFKRGIECIIQQLEETSLEEGGSRVFKIGTEFDWSKIHCLMMRECRRLDDGLPIFAFRQQILRQIHYQQVTVLIGETGSGKSTQLVQFLADCGVTGNGSIVCTQPRKLAANSLAQRVKQESEGCYEDNSIICYPSYSSGHKFDSKVVFMTDHCLLQHYMVDKSLSKISCIIVDEAHERSLDTDLLLALIKNLLLQRLDLRLVIMSATADAAQLADYFFGCGTFHVAGRTFPVDIEYVPCESSGCLGVGPISSYVYDVVKMVTEIHETEGEGTILAFLTSQIEVEWACVKFQTLSAISLPLHGKLSHEEQHRVFLSYPGKRKVIFTTNVAETSLTIPGVKYVVDSGMVKESRFEPGTCMSILRICNVSQSSAKQRAGRAGRTGPGRCYRLYSESDFEGMSHHQEPEIRKVHLGVAVLRILALGIKNVHDFDFVDAPSPKAIEMATRNLVQLGAVGKKDSAYELTIEGHKIIKLGIEPRLGKLILSCFNQRLSREGVVLAAVMANSSSIFCRVGSEGDKLKSDCLKVQFCHPNGDLFTLLSVYKEWEAVPKEGKNSWCWDNSINAKSMRRCQETVQELEACLKSELNIIVASYWHWDPQMHTEHDETLKRIILSSFAENVAMYSGYDQLGYEVALSKKYIQLHPSCSLLNFDRRPTWVVFGEILSAANEYLVCVTAFEFSSLSALSPSPLFNFLEMDAQKLEKKVLTGFGSMLLKRFCGKSNSSVNNLVSRIRTKYMDERIGIQVNVGKNEVLLYASSSDMESVLGQVNGALEYESKLLQNECLEKGLFSGGSAASASVALLGAGAIVKHLELKKRILAVDIFHSNTKAVDDKELLMFLERNTSSDICAVHKSSGTGHDNEENRWGRVTFLSPDAAKQAMLLNQVECNGGFLKVVPSRSVFSNDQKQFSSVLRTRVNWPRRCCNGVAIVKCEPNDVGFMVKDFSVVMIGGNTIRSKPSNKYSDSIVISGLNTDHSETEVLEILSGATDGKILDFFFVRGSAVENPPVAACEEALRREISPFMPKKAPFVQSIRVQVFQPEPKDTYMRASIMFDGSLHLEAAKALEHIDGKVLSGCLPWQKIRCQQQFHSSVSCPAPVYHVIRNQLDSLLPCLQRRNGVECNLERNENGSFRVKISASATKIVAELRRPLEQLMKGKIVDHVGISPTVVQLLFSREGNNIMKMVQQETGTYILFDRHSLSVRIFGSSDKIDMAERKFVNSLLALHESKQLEVHLRGGLLPLDLMKRVVQSFGPDLSGLKLKVPDAEFSLNTKRHCISVKGTKDMKQKVEEIISEIAHSGLPSIMMDNETDCPICLCELEDAYRLEGCTHTFCRSCLLEQCESAIRSREGFPLCCMHKGCGAHILVSDLRSLLSNDKLEELFRASLGAFVAASGGLYRFCPSPDCPSVYHVTESGEAGAPFICGACYVETCTSCHLEYHPYISCEKYKEFKDNPDFSLEEWAKGKENVKKCPVCGFTIEKIDGCNHIECKCGKHVCWVCLVFFSSSDDCYNHLRSLHQAIM*
MHDSSSYNRRFPAPAMYHQHCYRSSSNRPCRPGFYSSSYELDRPPGHSHKSPNFVIQLRYGNRRINRYGLDDLIEKLPFAPRSSFVFSKGFLSGSLLYDQWSETLEVIVKLWRMRLSGSHSFTPWVKRNVEVPSDEDELKGRVKMVFLEELKGLLVEGELLQKWEKKLELLRDEICELSRLLKNRNNLRVCNEFLKKREGLEKESDLIRKRIEEFKRGIECIIQQLEETSLEEGGSRVFKIGTEFDWSKIHCLMMRECRRLDDGLPIFAFRQQILRQIHYQQVTVLIGETGSGKSTQLVQFLADCGVTGNGSIVCTQPRKLAANSLAQRVKQESEGCYEDNSIICYPSYSSGHKFDSKVVFMTDHCLLQHYMVDKSLSKISCIIVDEAHERSLDTDLLLALIKNLLLQRLDLRLVIMSATADAAQLADYFFGCGTFHVAGRTFPVDIEYVPCESSGCLGVGPISSYVYDVVKMVTEIHETEGEGTILAFLTSQIEVEWACVKFQTLSAISLPLHGKLSHEEQHRVFLSYPGKRKVIFTTNVAETSLTIPGVKYVVDSGMVKESRFEPGTCMSILRICNVSQSSAKQRAGRAGRTGPGRCYRLYSESDFEGMSHHQEPEIRKVHLGVAVLRILALGIKNVHDFDFVDAPSPKAIEMATRNLVQLGAVGKKDSAYELTIEGHKIIKLGIEPRLGKLILSCFNQRLSREGVVLAAVMANSSSIFCRVGSEGDKLKSDCLKVQFCHPNGDLFTLLSVYKEWEAVPKEGKNSWCWDNSINAKSMRRCQETVQELEACLKSELNIIVASYWHWDPQMHTEHDETLKRIILSSFAENVAMYSGYDQLGYEVALSKKYIQLHPSCSLLNFDRRPTWVVFGEILSAANEYLVCVTAFEFSSLSALSPSPLFNFLEMDAQKLEKKVLTGFGSMLLKRFCGKSNSSVNNLVSRIRTKYMDERIGIQVNVGKNEVLLYASSSDMESVLGQVNGALEYESKLLQNECLEKGLFSGGSAASASVALLGAGAIVKHLELKKRILAVDIFHSNTKAVDDKELLMFLERNTSSDICAVHKSSGTGHDNEENRWGRVTFLSPDAAKQAMLLNQVECNGGFLKVVPSRSVFSNDQKQFSSVLRTRVNWPRRCCNGVAIVKCEPNDVGFMVKDFSVVMIGGNTIRSKPSNKYSDSIVISGLNTDHSETEVLEILSGATDGKILDFFFVRGSAVENPPVAACEEALRREISPFMPKKAPFVQSIRVQVFQPEPKDTYMRASIMFDGSLHLEAAKALEHIDGKVLSGCLPWQKIRCQQQFHSSVSCPAPVYHVIRNQLDSLLPCLQRRNGVECNLERNENGSFRVKISASATKIVAELRRPLEQLMKGKIVDHVGISPTVVQLLFSREGNNIMKMVQQETGTYILFDRHSLSVRIFGSSDKIDMAERKFVNSLLALHESKQLEVHLRGGLLPLDLMKRVVQSFGPDLSGLKLKVPDAEFSLNTKRHCISVKGTKDMKQKVEEIISEIAHSGLPSIMMDNETDCPICLCELEDAYRLEGCTHTFCRSCLLEQCESAIRSREGFPLCCMHKGCGAHILVSDLRSLLSNDKLEELFRASLGAFVAASGGLYRFCPSPDCPSVYHVTESGEAGAPFICGACYVETCTSCHLEYHPYISCEKYKEFKDNPDFSLEEWAKGKENVKKCPVCGFTIEKIDGCNHIECKCGKHVCWVCLVFFSSSDDCYNHLRSLHQAIM*
Related features
Related features
|
| Features that derive from this mRNA |
| Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
|---|---|---|---|---|---|
| polypeptide | Solyc04g014210.2.1 | SL2.50ch04:4509384..4517376 | 1,731 | + | n/a |
Add items to a list:
| Features this mRNA is a part of |
| Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
|---|---|---|---|---|---|
| gene | Solyc04g014210.2 | SL2.50ch04:4509385..4517601 | 8,217 | + | n/a |
Add items to a list:
| Features that are parts of this mRNA |
| Type | Name | Location | Length | Strand | Phase |
|---|---|---|---|---|---|
| exon | exon:Solyc04g014210.2.1.1 | SL2.50ch04:4509385..4510230 | 846 | + | n/a |
| exon | exon:Solyc04g014210.2.1.2 | SL2.50ch04:4512489..4515624 | 3,136 | + | n/a |
| exon | exon:Solyc04g014210.2.1.3 | SL2.50ch04:4516166..4517601 | 1,436 | + | 2 |
| intron | intron:Solyc04g014210.2.1.1 | SL2.50ch04:4510231..4512488 | n/a | + | n/a |
| intron | intron:Solyc04g014210.2.1.2 | SL2.50ch04:4515625..4516165 | n/a | + | n/a |
Add items to a list:
Related views
Related views
|
- Genetic loci
| User comments |
Please wait, checking for comments. (If comments do not show up, access them here)
Your Lists
Public Lists
List Contents
List Validation Report: Failed
Elements not found:
Optional: Add Missing Accessions to A List
Mismatched case
Click the Adjust Case button to align the case in the list with what is in the database.
Multiple mismatched case
Items listed here have mulitple case mismatches and must be fixed manually. If accessions need to be merged, contact the database directly.
List elements matching a synonym
Multiple synonym matches
Fuzzy Search Results
Synonym Search Results
Available Seedlots
Your Datasets
Public Datasets
Dataset Contents
Dataset Validation Failed
Elements not found:
Your Calendar
Having trouble viewing events on the calendar?
Are you associated with the breeding program you are interested in viewing?
Add New Event
Event Info
| Attribute | Value |
|---|---|
| Project Name: | |
| Start Date: | |
| End Date: | |
| Event Type: | |
| Event Description: | |
| Event Web URL: |
Edit Event
Login
Forgot Username
If you've forgotten your username, enter your email address below. An email will be sent with any account username(s) associated with your email address.
Reset Password
To reset your password, please enter your email address. A link will be sent to that address with a link that will enable you to reset your password.
Create New User
Working
Gene
Gene
