Clone Read LE_HBa0150N18_SP6_90898

Sequence Read 
Read Class
BAC ends
Read ID
LE_HBa0150N18_SP6_90898
Primer
SP6
ID from Seq. Facility
LE_HBa_150_N18-SP6
Chromatogram
[download]
Sequence 
Version
1 (current)
Length (bp)
541 trimmed for vector and quality, 819 raw
Genbank Accession
DU058964
Sequence
>LE_HBa0150N18_SP6_90898 (raw untrimmed)
AATTAATTCCATCATTATNNGCCTTGTAATCTTAGACACAAATCCCTCTTGCCTTGAAATTTTCTTCACTTGATTAAAACTTCTCTAGTCTTCCACACAC
AAAATTTGTATCACACGTAAATCTTTTTATAAAAATAATATTAAAAGATTGTATTTATAGGAAAAAATGTAGCTTTGGAATATGAAGATTAAGTTACAAA
TTTGAAAGGTCAAGTGTTACAAAAATTAAAAACAAATATTAATAAGAACATAAATTAATCTAGAAGATAAACCATACACATGTATCTATTTAAAGGGTAA
ATATTTAAAGAAGATAAATTAAATTAGATATTTTAATTAAGAATTAATCTAAAGAAGTGCAAAAGTCATTAACATTTCTATTAAAATACTATAATTAAAT
ATTTAAATTAAATAATTAAATATTTTTATATCATTTTAATTTGTAATAAGAGTAAAATTGTAATTCAACTTTTAACTTTTTTGGTTCCCTCTTATAATAA
TATATGATTAAAATAATTCAGAGTCAATCTTCAACGGATCACAAAATTTCAACGAATATACTCTCAAGGGTATGACTATCCCAATAAAGCGATTACATTG
TCAAGTCTGAAGAAATATCATTTTTAAAACAATGTTTTATTTGCCCCAAAATACAATATGTATTCACTCTGCGTTAAGAAAATGGCTGTTAAGATATGCC
TTGAACTTTTTTTGTTTTACCTATATTATGTAATCTCCCCTCCCGCCTTTAAAACTGTCCTTTTTGGTGTCTTTCGAACTTAACTTAATTAAATTTTTAA
AGATTTAAATTACTTTCTC
>LE_HBa0150N18_SP6_90898 (trimmed for quality and cloning vector)
CTTGTAATCTTAGACACAAATCCCTCTTGCCTTGAAATTTTCTTCACTTGATTAAAACTTCTCTAGTCTTCCACACACAAAATTTGTATCACACGTAAAT
CTTTTTATAAAAATAATATTAAAAGATTGTATTTATAGGAAAAAATGTAGCTTTGGAATATGAAGATTAAGTTACAAATTTGAAAGGTCAAGTGTTACAA
AAATTAAAAACAAATATTAATAAGAACATAAATTAATCTAGAAGATAAACCATACACATGTATCTATTTAAAGGGTAAATATTTAAAGAAGATAAATTAA
ATTAGATATTTTAATTAAGAATTAATCTAAAGAAGTGCAAAAGTCATTAACATTTCTATTAAAATACTATAATTAAATATTTAAATTAAATAATTAAATA
TTTTTATATCATTTTAATTTGTAATAAGAGTAAAATTGTAATTCAACTTTTAACTTTTTTGGTTCCCTCTTATAATAATATATGATTAAAATAATTCAGA
GTCAATCTTCAACGGATCACAAAATTTCAACGAATATACTC

Warnings:
  • Not screened for chimera
  • Not screened for repetitive elements
Quality Report
Processed by
SGN
Vector signature
flanking vector not found in read
Quality trim threshold
20.5
Sequence entropy
0.860484
Expected error %
0.153671
Sequence Annotations 
Automatic Annotations
No automatic annotations found.
Manual Annotations
No manual annotations found.
BAC 
Clone LE_HBa0150N18
Clone
Clone name
hba-150n18
LE_HBa0150N18
P150N18
Clone type
BAC
Contamination
none
Estimated length
not yet estimated
Library
Name
Tomato HindIII BAC Library
Cloning host
E. coli
Organism
Solanum lycopersicum (formerly Lycopersicon esculentum)
Cloning vector
pBeloBAC11
Accession
Heinz 1706
Restriction enzyme
HindIII

Other Reads:
1 sequencing reads found