C02HBa0168N10.1 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1 8104 FBgn:temp1:C02HBa0168N10.1 gene blastp on nr: homology over whole length to H0313F03.14 [Oryza sativa (indica cultivar-group)]; Length=222; Identities = 149/222 (67%), Positives = 178/222 (80%), Gaps = 0/222 (0%) --- NOTE: there are several other homologue proteins that have a longer N-terminus Maren Administrator Fri Sep 01 11:04:32 GMT 2006 An example where the unmasked alignments make sense heiko Tue Sep 05 13:45:02 GMT 2006 FBgn:temp1:C02HBa0168N10.1-RC transcript heiko Tue Sep 05 13:47:26 GMT 2006 polypeptide FBgn:temp1:C02HBa0168N10.1-PC 7847 559 exon 7904 7804 exon 7136 7069 exon 6972 6888 exon 6794 6636 exon 5389 5252 exon 4721 4643 exon 3074 2995 exon 1557 1428 exon 660 201 FBgn:temp11:C02HBa0168N10.1-RA GATGATGCAAGATGTTTGGAATCAGTTAGGTCCAGCCATTGCAACAATCA TGTTTGCCTGGACCATGTACCAGAACTATTTCCCTCATGAACTTCGTGGC CATATTCGAAGGTATACCGATAAACTTGTGAGCTATATCTATCCTTATAT ACATATTACATTTCATGAATATGAAACTGATGGTTGGTTTGAGCGTAGTA AAGCTTATGAAGCTATCGAAAGGTATTTAAGTAAGAACTCTAGTATACAA 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